More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0838 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
304 aa  619  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 
298 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  30.4 
 
 
308 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
306 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 
295 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  28.21 
 
 
303 aa  121  1e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 
311 aa  120  2e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  22.71 
 
 
304 aa  120  2e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 
300 aa  120  4e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
308 aa  117  2e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  26.86 
 
 
315 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  26.41 
 
 
283 aa  115  7e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
300 aa  114  1e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 
312 aa  114  1e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  26.48 
 
 
309 aa  115  1e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  24.51 
 
 
309 aa  115  1e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 
287 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 
302 aa  111  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
288 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 
306 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.11 
 
 
305 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  26.29 
 
 
291 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  27.05 
 
 
305 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.05 
 
 
305 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.05 
 
 
305 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.05 
 
 
305 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.05 
 
 
305 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.05 
 
 
305 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.05 
 
 
305 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.05 
 
 
305 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 
305 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  26.36 
 
 
321 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  25.56 
 
 
308 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  26.59 
 
 
316 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  26.12 
 
 
327 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  25.4 
 
 
288 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
292 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  25.26 
 
 
319 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  25.08 
 
 
308 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.10908e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  7.41656e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  3.32798e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.62 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  26.11 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  24.21 
 
 
305 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.62 
 
 
302 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  25.5 
 
 
297 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  22.07 
 
 
328 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  23.69 
 
 
324 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.62 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.62 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.62 
 
 
305 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  25.43 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  23.67 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  25.38 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  23.77 
 
 
315 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
313 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
339 aa  96.3  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  28.94 
 
 
320 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  23.83 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
300 aa  95.5  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.27 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  24.08 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.15182e-05  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  23.26 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  25.36 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.27 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.86 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.27 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 
311 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  24.64 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  24.52 
 
 
314 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 
313 aa  92  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  23.66 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  22.58 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0036  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.35 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  22.95 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  22.18 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  23.73 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  22.31 
 
 
315 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
293 aa  89  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  22.69 
 
 
298 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  24.16 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  35 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  23.43 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0677  putative transcriptional activator METR transcription regulator protein  26.04 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0439978  normal  0.107972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  23.02 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  25.9 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
298 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1091  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 
300 aa  85.1  1e-15  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
308 aa  85.5  1e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>