167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0827 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 392 aa  768    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  35.54 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  36.1 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  31.79 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  32.12 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  31.21 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  32.04 
 
 		 387 aa  152  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  29.2 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  29.23 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  29.86 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  33.89 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  28.4 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  28.42 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  27.65 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.53 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.52 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 484 aa  52.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  25.26 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.58 
 
 		 477 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 511 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  23.53 
 
 		 497 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  26.26 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  25.77 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 446 aa  50.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 474 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  24.32 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.03 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 516 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  25.63 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  25.63 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.12 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  25.63 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.12 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  25.63 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 520 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  21.46 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.12 
 
 		 478 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  26.98 
 
 		 579 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  19.29 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 465 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.15 
 
 		 485 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 487 aa  46.6  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  25.29 
 
 		 498 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  29.34 
 
 		 465 aa  46.6  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  23.74 
 
 		 393 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  20.56 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>