93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0811 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  100 
 
 
348 aa  691    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  56.32 
 
 
348 aa  372  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  56.61 
 
 
348 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  56.03 
 
 
348 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  41.36 
 
 
352 aa  282  6.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  42.2 
 
 
350 aa  276  4e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  39.38 
 
 
353 aa  267  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  40.11 
 
 
349 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  40.11 
 
 
349 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  37.78 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  36.41 
 
 
349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  38.16 
 
 
357 aa  212  7e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  32.4 
 
 
354 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  32.4 
 
 
354 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 
354 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  32.4 
 
 
354 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  32.68 
 
 
354 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  32.68 
 
 
354 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
354 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
354 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
354 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  32.68 
 
 
354 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  30.77 
 
 
362 aa  146  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 
350 aa  133  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 
368 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  28.65 
 
 
351 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  28.65 
 
 
351 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  23.71 
 
 
331 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  23.29 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  21.88 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 
347 aa  84  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  23.9 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.55 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.57 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  21.86 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  21.7 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  22.02 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.91 
 
 
386 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  19.19 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  22.99 
 
 
410 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  20.66 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  22.28 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.38 
 
 
328 aa  53.9  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  30 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  27.35 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  22.28 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  23.18 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  24.31 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  20.64 
 
 
383 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  28.33 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  19.12 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  28.33 
 
 
401 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  21.11 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  28.33 
 
 
401 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  28.33 
 
 
401 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  29.17 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  23.45 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  22.11 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  21.41 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  20.92 
 
 
366 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 
378 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  29.6 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  26 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 
399 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  26 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  22.42 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  27.73 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  24.67 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  19.44 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  24.67 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  24.67 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  24.67 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  21.71 
 
 
809 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  24.84 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  20.94 
 
 
399 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  21.67 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 
399 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  23.81 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.51 
 
 
375 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 
401 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  24.5 
 
 
390 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  20.45 
 
 
386 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  24.39 
 
 
390 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  20.92 
 
 
401 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  22.61 
 
 
389 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  20.71 
 
 
401 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  19.21 
 
 
378 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  19.21 
 
 
378 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  24.69 
 
 
390 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>