78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0781 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  100 
 
 		 259 aa  533  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  49.59 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  39.13 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  32.02 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  32.26 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 253 aa  145  9e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  30.99 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  31.82 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  31.33 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  26.83 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  26.02 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  26.02 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  25.61 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  26.53 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  23.77 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  23.77 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  26.53 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  22.36 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  23.87 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  22.03 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  21.72 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  29.29 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  24.31 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  21.24 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  22.58 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  22.75 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  25.35 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  21.26 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  25.42 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  27.7 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  25 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  27.7 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  24.86 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  21.49 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  29.33 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  26.43 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  26.57 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl267  DNA repair/recombination protein  24.63 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227319  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  23.73 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  27.13 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  23.73 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  23.73 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  21.77 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  21.72 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  23.73 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  24.52 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03961  putative recombination protein O  34.02 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  24.05 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  24.05 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  22.13 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  24.05 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  24.05 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  24.05 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  22.98 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  24.17 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  23.56 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  32.53 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  22.33 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  22.97 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1377  DNA repair protein RecO  27.89 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  22.64 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  25.48 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0642  DNA repair protein RecO  19.65 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  22.55 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1446  DNA repair protein RecO  28.04 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.817511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  23.63 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  22.55 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  22.55 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  27.67 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>