More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0685 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
259 aa  537  1e-152  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.23 
 
 
270 aa  300  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.41789e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.14 
 
 
250 aa  299  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  1.70757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.15 
 
 
254 aa  297  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.12 
 
 
249 aa  295  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  8.56656e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.2 
 
 
258 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.92152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.59 
 
 
257 aa  287  9e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.18 
 
 
258 aa  278  8e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.18 
 
 
258 aa  278  8e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.79 
 
 
258 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.79 
 
 
258 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.79 
 
 
258 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.79 
 
 
258 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.79 
 
 
258 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.65 
 
 
258 aa  273  2e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
257 aa  272  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  272  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  2.72675e-13 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.36 
 
 
258 aa  269  3e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.54 
 
 
256 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.54 
 
 
256 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0805  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.48 
 
 
239 aa  266  3e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  6.55328e-09  hitchhiker  2.26437e-08 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  52.77 
 
 
240 aa  262  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.40477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
256 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 
254 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.6 
 
 
256 aa  256  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  5.49234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.52 
 
 
257 aa  254  1e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  5.6248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.15 
 
 
247 aa  254  1e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.02 
 
 
249 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2435  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.28 
 
 
244 aa  252  4e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  1.70517e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
253 aa  251  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
253 aa  251  7e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.56 
 
 
259 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  1.15387e-08 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  45.97 
 
 
263 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
264 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
244 aa  244  1e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
249 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
246 aa  242  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.38 
 
 
252 aa  242  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.93058e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
249 aa  241  7e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.89 
 
 
249 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.03 
 
 
249 aa  239  3e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
266 aa  239  3e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.9604e-05  hitchhiker  6.36808e-08 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.28 
 
 
256 aa  238  7e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.28 
 
 
256 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
249 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 
260 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.13 
 
 
243 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.3 
 
 
251 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.89 
 
 
251 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.15 
 
 
267 aa  233  2e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  48.28 
 
 
247 aa  233  2e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.73 
 
 
266 aa  233  2e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
248 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.33358e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
253 aa  232  4e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
256 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.2739e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  46.22 
 
 
260 aa  231  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.07 
 
 
245 aa  231  8e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  46.47 
 
 
251 aa  230  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  46.58 
 
 
233 aa  230  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  44.02 
 
 
288 aa  231  1e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.55 
 
 
246 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
272 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  3.40539e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.19 
 
 
246 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  47.46 
 
 
232 aa  229  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  45.11 
 
 
251 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
241 aa  228  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.5 
 
 
256 aa  228  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.5897e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.76 
 
 
257 aa  228  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.23 
 
 
265 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 
253 aa  228  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  46.77 
 
 
254 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.02 
 
 
249 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 
253 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  46.41 
 
 
253 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.05538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.45579e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
258 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.41 
 
 
253 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.41 
 
 
253 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  45.34 
 
 
251 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.19 
 
 
252 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
227 aa  226  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.41 
 
 
253 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.41 
 
 
253 aa  226  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 
255 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.02 
 
 
251 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
271 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.45031e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  45.23 
 
 
251 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 
246 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.34 
 
 
251 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  41.53 
 
 
276 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.53 
 
 
238 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.1 
 
 
248 aa  226  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.53 
 
 
238 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.34 
 
 
267 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.69 
 
 
243 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.3 
 
 
236 aa  225  5e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  45.61 
 
 
247 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>