More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0664 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  443  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  63.55 
 
 
212 aa  252  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  52.97 
 
 
214 aa  234  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  54.38 
 
 
215 aa  216  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  46.73 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  48.28 
 
 
216 aa  197  9e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  44.5 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  42.73 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  44.09 
 
 
220 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  44.04 
 
 
219 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  44.04 
 
 
219 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  44.04 
 
 
219 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  43.58 
 
 
219 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  40.72 
 
 
224 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  45.19 
 
 
219 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  45.19 
 
 
219 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  45.19 
 
 
219 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  45.19 
 
 
219 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  45.19 
 
 
219 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  45.19 
 
 
219 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  47 
 
 
219 aa  191  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  43.32 
 
 
220 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  44.71 
 
 
219 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  44.23 
 
 
219 aa  188  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  44.23 
 
 
219 aa  187  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  42.86 
 
 
221 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  45.63 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  43.64 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  44.6 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  42.73 
 
 
220 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  42.73 
 
 
220 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  42.73 
 
 
220 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  41.94 
 
 
237 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  42.01 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  48.66 
 
 
214 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  41.75 
 
 
221 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  41.18 
 
 
232 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  43.84 
 
 
218 aa  177  8e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  42.93 
 
 
218 aa  177  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  43.52 
 
 
216 aa  176  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  41.26 
 
 
221 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  41.86 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  42.99 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  43.19 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  40.5 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  44.1 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  48.02 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  43.26 
 
 
230 aa  172  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  39.35 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  45.63 
 
 
213 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  43.46 
 
 
218 aa  170  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  39.81 
 
 
216 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  44.95 
 
 
227 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  40.62 
 
 
222 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  42.16 
 
 
219 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  39.32 
 
 
217 aa  168  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  43.58 
 
 
219 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  40.74 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  39.37 
 
 
218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  42.25 
 
 
216 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  42.18 
 
 
230 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  42.35 
 
 
279 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  43 
 
 
215 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  38.12 
 
 
215 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  42.86 
 
 
214 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  37.62 
 
 
215 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  41.04 
 
 
213 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  42.13 
 
 
216 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  43.81 
 
 
222 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  41.71 
 
 
201 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  39.02 
 
 
227 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  37.91 
 
 
214 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  34.84 
 
 
218 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  37.44 
 
 
214 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2641  SNARE associated Golgi protein  42.79 
 
 
226 aa  156  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  36.32 
 
 
220 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  39.73 
 
 
217 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  40.1 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  39.09 
 
 
219 aa  154  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  43 
 
 
215 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  41.29 
 
 
215 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  37.79 
 
 
215 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  38.21 
 
 
215 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  38.39 
 
 
223 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  42 
 
 
231 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  39.5 
 
 
213 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  40 
 
 
215 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
215 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  44.17 
 
 
262 aa  151  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  37.44 
 
 
223 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  41.29 
 
 
215 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  41.29 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  41.29 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  37.84 
 
 
227 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.48 
 
 
213 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  40.51 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  36.7 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  38.6 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  38.6 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>