More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0651 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  56.42 
 
 
879 aa  737    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0651  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 
730 aa  1496    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.188168  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  49.85 
 
 
754 aa  624  1e-177  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  48.56 
 
 
791 aa  609  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0298  penicillin-binding protein 1A  41.56 
 
 
750 aa  459  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.376505  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0277  penicillin-binding protein 1A  42.11 
 
 
773 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0542  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  42.5 
 
 
623 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.158296  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  39.09 
 
 
912 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  36.56 
 
 
839 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  36.27 
 
 
832 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  36.42 
 
 
830 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  37.73 
 
 
836 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  35.31 
 
 
837 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  35.75 
 
 
834 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  37.56 
 
 
835 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  35.89 
 
 
834 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  35.6 
 
 
846 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  35.6 
 
 
820 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  38.38 
 
 
794 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  35.02 
 
 
837 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  38.65 
 
 
901 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  36.52 
 
 
897 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  35.29 
 
 
865 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  36.11 
 
 
897 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  35.69 
 
 
905 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  36.04 
 
 
897 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  36.11 
 
 
896 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  36.11 
 
 
897 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  36.11 
 
 
897 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  36.11 
 
 
900 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  36.57 
 
 
647 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  34.86 
 
 
914 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1020  penicillin-binding protein 2  35.42 
 
 
743 aa  360  6e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
727 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
727 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  35.16 
 
 
765 aa  343  8e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  35.35 
 
 
727 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
795 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.07 
 
 
761 aa  300  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  32.93 
 
 
880 aa  298  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  34.53 
 
 
814 aa  295  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  32.61 
 
 
727 aa  293  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  32.33 
 
 
828 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.64 
 
 
905 aa  286  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  35.71 
 
 
709 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  33.01 
 
 
829 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  30.75 
 
 
721 aa  259  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  29.86 
 
 
705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  29.15 
 
 
806 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  32.21 
 
 
735 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  31.71 
 
 
732 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  30.97 
 
 
706 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.41 
 
 
743 aa  248  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  30.69 
 
 
679 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  31.89 
 
 
734 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  32.01 
 
 
683 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.79 
 
 
761 aa  246  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  32.18 
 
 
683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  32.3 
 
 
683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  32.3 
 
 
683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  32.3 
 
 
683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  32.3 
 
 
683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.49 
 
 
685 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  32.36 
 
 
683 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  30.14 
 
 
705 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  30.14 
 
 
705 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
831 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  30.14 
 
 
705 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  29.97 
 
 
705 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  31.21 
 
 
775 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  32.36 
 
 
683 aa  243  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  30.1 
 
 
788 aa  243  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  33 
 
 
773 aa  243  9e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  32.3 
 
 
683 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.4 
 
 
739 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  30.48 
 
 
681 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  29.79 
 
 
705 aa  242  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  30.65 
 
 
705 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  31.05 
 
 
830 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  31.13 
 
 
820 aa  241  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.25 
 
 
683 aa  241  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  29.39 
 
 
705 aa  241  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  32.19 
 
 
683 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  29.62 
 
 
746 aa  240  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  30.69 
 
 
680 aa  240  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  29.92 
 
 
746 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.41 
 
 
676 aa  239  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  28.66 
 
 
705 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.76 
 
 
734 aa  238  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31.31 
 
 
618 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  30.8 
 
 
680 aa  237  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  29.2 
 
 
704 aa  237  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  30.36 
 
 
667 aa  237  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  30.54 
 
 
642 aa  237  7e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  30.05 
 
 
680 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.42 
 
 
661 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  31.65 
 
 
728 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  29.56 
 
 
941 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  31.72 
 
 
658 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  30.2 
 
 
680 aa  235  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>