More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0612 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 351 aa  716    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.48 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.47 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.24 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2515  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.64 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.75499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.13 
 
 		 333 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.77 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.39 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.08 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.81 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.86 
 
 		 318 aa  413  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.32 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.61 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.97 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 		 354 aa  394  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.01 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.42 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.7 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.36 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.06 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.89 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.13 
 
 		 354 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.36 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 343 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.89 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.33 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.46 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.44 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.31 
 
 		 338 aa  384  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.44 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 336 aa  384  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  58.41 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.46 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 345 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.49 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.26 
 
 		 337 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.88 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.57 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.38 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 		 335 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.72 
 
 		 386 aa  381  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 		 334 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.36 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.03 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.88 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 338 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.44 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>