38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0533 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  100 
 
 		 258 aa  499  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0867  hypothetical protein  54.04 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  52.38 
 
 		 258 aa  222  6e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  37.44 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0459  YibE/F family protein  39.56 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  31.45 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  27.86 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  27.86 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  26.95 
 
 		 404 aa  82  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  28.33 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  25.38 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  25.88 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  25.53 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  26.52 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  27.8 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1824  multitransmembrane protein  26.15 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  28.42 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  27.92 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  26.64 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  24.89 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  24.33 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  27.87 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  27.87 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  29.46 
 
 		 434 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  25.96 
 
 		 409 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  20.85 
 
 		 428 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  24.68 
 
 		 416 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  24.28 
 
 		 484 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  22.13 
 
 		 499 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  24.02 
 
 		 446 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  28.71 
 
 		 386 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  29.73 
 
 		 395 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  23.3 
 
 		 449 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  22.8 
 
 		 436 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  23.3 
 
 		 448 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  22.02 
 
 		 397 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  29.03 
 
 		 396 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  22.59 
 
 		 484 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>