35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0532 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  100 
 
 		 361 aa  724    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  43.84 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  44.86 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  38.1 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  36.48 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  31.14 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  30.77 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  30.77 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  26.46 
 
 		 393 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  24.56 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  25.82 
 
 		 599 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  28.48 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  26.01 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  26.5 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  28.29 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  24.01 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  28.02 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  29.69 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  25.86 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  25.26 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  23.24 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  25.82 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  31.25 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  26.61 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  23.45 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  27.19 
 
 		 446 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  26.79 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  25 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  22.13 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  19.57 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  27.38 
 
 		 370 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  23.12 
 
 		 395 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  17.19 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  17.19 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  20.08 
 
 		 406 aa  42.7  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>