More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0510 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0480  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00570822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  39.83 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  39.42 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 300 aa  154  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  37.39 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  36.97 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  37.39 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  37.39 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  36.97 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  36.97 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  36.97 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  36.97 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  36.97 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  37.45 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0603  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.971454  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  36.44 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  27.95 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  27.95 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  26.47 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.47 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.47 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  26.47 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.47 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  29.17 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.05 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  28.66 
 
 		 579 aa  76.3  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  26.32 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4822  transcriptional regulator, GntR family  25.79 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  26.32 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3766  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  27 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  27.43 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  25.11 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>