More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0486 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
277 aa  560  1e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  53.38 
 
 
279 aa  285  5e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  52.67 
 
 
266 aa  266  3e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  48.83 
 
 
270 aa  234  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0143  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 
275 aa  232  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
270 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 
266 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 
270 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
268 aa  224  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
271 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
270 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
265 aa  221  8e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.85147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
269 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
268 aa  221  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 
272 aa  221  1e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
436 aa  220  2e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 
264 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 
270 aa  219  4e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 
270 aa  219  4e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 
270 aa  219  4e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 
270 aa  219  4e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
266 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
262 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 
270 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
268 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
267 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  48.13 
 
 
270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 
267 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  48.51 
 
 
273 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 
264 aa  215  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 
278 aa  215  8e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  9.68277e-14 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 
271 aa  214  1e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  48.13 
 
 
270 aa  214  1e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.10773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  47.39 
 
 
270 aa  214  1e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
265 aa  214  2e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  44.09 
 
 
260 aa  213  2e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 
264 aa  213  4e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 
267 aa  212  6e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  47.76 
 
 
270 aa  211  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
264 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1368  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 
272 aa  210  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
266 aa  208  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
288 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
288 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
264 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
288 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
266 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67736e-05 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
268 aa  205  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 
264 aa  204  9e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
490 aa  204  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 
271 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1271  phosphomethylpyrimidine kinase  41.33 
 
 
271 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.1939e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 
268 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 
267 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  43.31 
 
 
257 aa  203  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  45.11 
 
 
275 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 
273 aa  202  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 
267 aa  200  2e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  43.7 
 
 
260 aa  201  2e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 
269 aa  199  4e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
266 aa  198  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
272 aa  198  8e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
276 aa  198  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
276 aa  198  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
266 aa  197  2e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
267 aa  197  2e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 
268 aa  196  2e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  41.28 
 
 
278 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
267 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 
267 aa  196  4e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
264 aa  196  4e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
266 aa  195  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
266 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
266 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
266 aa  195  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
266 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
266 aa  195  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
266 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 
285 aa  195  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
266 aa  195  8e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
269 aa  194  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 
266 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
263 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 
260 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  41.8 
 
 
266 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 
266 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
266 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 
266 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 
266 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 
266 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 
270 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 
267 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 
266 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 
266 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 
266 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  40.84 
 
 
270 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  40.84 
 
 
270 aa  192  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 
285 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
295 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  42.58 
 
 
450 aa  192  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>