38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0471 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0471  putative glucose uptake permease  100 
 
 
321 aa  624  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000523457  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1714  putative glucose uptake permease  63.17 
 
 
315 aa  399  1e-110  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4859  glucose uptake protein  38.34 
 
 
285 aa  190  3e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0407  glucose uptake protein  37.7 
 
 
285 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4835  glucose uptake protein  38.02 
 
 
285 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4829  glucose uptake protein  37.38 
 
 
285 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4613  glucose uptake protein  38.02 
 
 
285 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4969  glucose uptake protein  38.02 
 
 
285 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4548  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  39.66 
 
 
285 aa  185  1e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4853  glucose uptake protein  37.7 
 
 
285 aa  185  1e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4449  glucose uptake protein  39.66 
 
 
285 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4467  glucose uptake protein  38.64 
 
 
285 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0184  sugar transport family protein  37.38 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3389  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  38.78 
 
 
285 aa  174  2e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5101  putative transporter  36.42 
 
 
283 aa  173  4e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0200  transporter  36.74 
 
 
283 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0225  putative transporter  36.74 
 
 
283 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0190  glucose uptake protein  36.74 
 
 
283 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0187  glucose uptake protein  36.74 
 
 
283 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0242  putative transporter  36.74 
 
 
283 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0200  transporter  36.74 
 
 
283 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0220  glucose uptake protein  36.74 
 
 
283 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0219  putative transporter  36.74 
 
 
283 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0198  sugar transport family protein  36.42 
 
 
283 aa  165  1e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0891  putative glucose uptake permease  35.81 
 
 
295 aa  163  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  9.19677e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2157  transporter, putative  34.74 
 
 
278 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000281775  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0367  glucose uptake protein  39.34 
 
 
251 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316685  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1838  sugar transporter, putative  35.49 
 
 
287 aa  141  2e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00199783  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2324  sugar transport family protein  35.93 
 
 
287 aa  141  2e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2283  sugar transport family protein  35.93 
 
 
287 aa  141  2e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2601  putative glucose uptake permease  33.33 
 
 
261 aa  135  8e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0031  sugar transport family protein  30.65 
 
 
287 aa  131  2e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.4774e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0418  sugar transport family protein  29.45 
 
 
286 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.67912e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0261  sugar transport family protein  28.98 
 
 
293 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0255  sugar transport family protein  28.98 
 
 
293 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2102  hypothetical protein  25.85 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1040  ribose transport protein  26.73 
 
 
296 aa  83.2  6e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0172  putative glucose uptake permease  23.93 
 
 
287 aa  82  1e-14  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.3856e-11  hitchhiker  4.93934e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>