More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0450 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0450  50S ribosomal protein L31 type B  100 
 
 
88 aa  181  4e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000490006  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1784  50S ribosomal protein L31P  65.38 
 
 
80 aa  119  2e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  5.81965e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0787  50S ribosomal protein L31 type B  66.67 
 
 
80 aa  117  5e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0536  50S ribosomal protein L31 type B  65.38 
 
 
86 aa  116  8e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000345186  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0233  50S ribosomal protein L31 type B  70.89 
 
 
81 aa  115  1e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.4812e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0263  50S ribosomal protein L31 type B  59.52 
 
 
83 aa  112  2e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2156  50S ribosomal protein L31 type B  60.47 
 
 
84 aa  108  2e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.475244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2194  50S ribosomal protein L31 type B  60.47 
 
 
84 aa  108  2e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0620281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1727  50S ribosomal protein L31 type B  56.82 
 
 
85 aa  106  9e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  8.29629e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5031  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 
81 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  7.68356e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5015  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 
81 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.65969e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5180  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 
81 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00675998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5454  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 
81 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.23612e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5423  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 
81 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.27581e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5509  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 
81 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.43327e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5458  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 
81 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.28579e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5574  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 
81 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.88465e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3852  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 
81 aa  103  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.64047e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5498  50S ribosomal protein L31 type B  59.49 
 
 
81 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.31175e-10  unclonable  2.48072e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5129  50S ribosomal protein L31 type B  58.23 
 
 
81 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.7521e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0923  ribosomal protein L31  53.25 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.587387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1703  50S ribosomal protein L31 type B  54.43 
 
 
81 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  3.92946e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0125  ribosomal protein L31  52.5 
 
 
83 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.2592e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0526  ribosomal protein L31  55.84 
 
 
79 aa  93.6  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0947  50S ribosomal protein L31 type B  50.63 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589085  normal  0.576162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1878  50S ribosomal protein L31 type B  51.19 
 
 
85 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3289  ribosomal protein L31  51.85 
 
 
87 aa  92  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2367  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000177904  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0873  50S ribosomal protein L31 type B  50.63 
 
 
80 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00543783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1820  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0400323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6358  ribosomal protein L31  50 
 
 
90 aa  90.1  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2127  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
85 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.029329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0037  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2253  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
87 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.081991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0614  ribosomal protein L31  56.41 
 
 
80 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0402  50S ribosomal protein L31 type B  46.91 
 
 
85 aa  88.6  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.44485e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1131  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2380  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
87 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2215  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
87 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1860  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1369  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 
87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00759194  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0786  50S ribosomal protein L31 type B  50.63 
 
 
80 aa  88.2  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5333  50S ribosomal protein L31 type B  47.56 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0234  50S ribosomal protein L31 type B  53.85 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0913753  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1440  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219049  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11640  LSU ribosomal protein L31P  46.43 
 
 
85 aa  87.4  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1857  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316845  normal  0.0801388 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2207  50S ribosomal protein L31 type B  48.15 
 
 
93 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0240279  normal  0.0216072 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0507  50S ribosomal protein L31 type B  45.45 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  8.69204e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6246  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235977  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0758  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1833  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.012708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1916  50S ribosomal protein L31 type B  48.15 
 
 
93 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  2.48892e-09  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2250  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1495  ribosomal protein L31  48.1 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2751  50S ribosomal protein L31 type B  50.63 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.178212  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2213  50S ribosomal protein L31 type B  47.44 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0489  50S ribosomal protein L31P  50 
 
 
80 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2363  50S ribosomal protein L31P  48.1 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0169896  normal  0.930447 
 
 
-
 
NC_002620  TC0291  50S ribosomal protein L31 type B  49.37 
 
 
108 aa  85.5  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  3.93408e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2137  50S ribosomal protein L31P  47.44 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171095  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0890  50S ribosomal protein L31 type B  46.91 
 
 
85 aa  84.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4909  ribosomal protein L31  46.84 
 
 
81 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.665913  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1430  ribosomal protein L31  47.44 
 
 
109 aa  84  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.332477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1117  50S ribosomal protein L31 type B  46.15 
 
 
86 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0238519  normal  0.245393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1025  50S ribosomal protein L31 type B  46.15 
 
 
86 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.010082  normal  0.336183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02360  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
80 aa  83.6  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03250  50S ribosomal protein L31 type B  45.68 
 
 
86 aa  82.8  1e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3254  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
80 aa  83.2  1e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1771  50S ribosomal protein L31 type B  44.87 
 
 
87 aa  82.4  2e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2120  50S ribosomal protein L31 type B  47.44 
 
 
86 aa  82.4  2e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6211  ribosomal protein L31  51.25 
 
 
83 aa  82.4  2e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5134  50S ribosomal protein L31 type B  44.87 
 
 
86 aa  82.4  2e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.593671  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1744  50S ribosomal protein L31 type B  44.87 
 
 
87 aa  82.4  2e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372125  normal  0.163182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4797  ribosomal protein L31  46.84 
 
 
84 aa  81.3  4e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168745  normal  0.0677805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1539  50S ribosomal protein L31 type B  45.68 
 
 
83 aa  81.3  4e-15  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2291  50S ribosomal protein L31P  45.57 
 
 
80 aa  81.3  5e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.43826e-07  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1068  50S ribosomal protein L31 type B  43.75 
 
 
82 aa  79.7  1e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.788899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1540  50S ribosomal protein L31 type B  49.38 
 
 
87 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.267597  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3270  ribosomal protein L31  46.84 
 
 
80 aa  79.7  1e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4415  ribosomal protein L31  53.16 
 
 
83 aa  80.1  1e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000833435  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3243  50S ribosomal protein L31 type B  43.75 
 
 
82 aa  80.1  1e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17700  50S ribosomal protein L31 type B  48.15 
 
 
87 aa  79.3  2e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.11738e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002727  LSU ribosomal protein L31p  43.21 
 
 
86 aa  78.6  3e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0694209  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1309  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
115 aa  78.6  3e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4370  ribosomal protein L31  44.87 
 
 
85 aa  78.2  4e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.0154955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04220  LSU ribosomal protein L31P  44.3 
 
 
90 aa  78.2  4e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11228  50S ribosomal protein L31  44.44 
 
 
93 aa  77.8  4e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0934  50S ribosomal protein L31 type B  42.5 
 
 
86 aa  77.8  5e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.626009  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0637  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
115 aa  77.8  5e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1125  50S ribosomal protein L31 type B  42.5 
 
 
85 aa  77.4  6e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.13817e-11  unclonable  9.42965e-09 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4183  ribosomal protein L31  42.05 
 
 
93 aa  76.6  9e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2901  50S ribosomal protein L31 type B  43.9 
 
 
87 aa  76.3  1e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1182  50S ribosomal protein L31 type B  43.04 
 
 
87 aa  75.5  2e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000836731  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1281  50S ribosomal protein L31P  44.71 
 
 
105 aa  74.7  4e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3210  50S ribosomal protein L31 type B  42.5 
 
 
86 aa  74.7  4e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.21359e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3069  50S ribosomal protein L31 type B  42.5 
 
 
86 aa  74.7  4e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.10259e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2857  50S ribosomal protein L31 type B  45.12 
 
 
86 aa  74.7  4e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0109  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
84 aa  74.3  5e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.22097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7574  ribosomal protein L31  43.04 
 
 
81 aa  73.9  6e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>