248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0383 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 396 aa  776    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 405 aa  355  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  42.72 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  36.1 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  33.96 
 
 		 399 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  32.38 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  30.35 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  28.93 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  30.77 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  28.22 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  25.19 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  25.52 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  26.56 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  29.79 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.4 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  23.57 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 474 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 490 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  23.57 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3190  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.19 
 
 		 487 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 511 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  24.85 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1697  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.9 
 
 		 482 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.95 
 
 		 620 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  29.06 
 
 		 481 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.52 
 
 		 500 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 459 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 392 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  26.99 
 
 		 513 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2586  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941296  hitchhiker  0.00272882 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  22.7 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 488 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.26 
 
 		 518 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.99 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 494 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>