More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0375 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
411 aa  823    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  30.29 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  29.43 
 
 
400 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  29.47 
 
 
506 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  29.47 
 
 
400 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  28.61 
 
 
447 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  30 
 
 
505 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  30 
 
 
399 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  29.47 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  28.91 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  28.65 
 
 
400 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  29.47 
 
 
506 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
391 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
404 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  31.3 
 
 
381 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  30.23 
 
 
399 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  31.59 
 
 
384 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  30.47 
 
 
381 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  30.47 
 
 
381 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  31.02 
 
 
381 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  30.47 
 
 
381 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  30.47 
 
 
381 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
381 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  30.94 
 
 
381 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  30.33 
 
 
399 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  30.33 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  31.02 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  29.82 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
401 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  29.82 
 
 
399 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.41 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
396 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
415 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  29.03 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  26.12 
 
 
390 aa  110  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  26.1 
 
 
392 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  25.74 
 
 
387 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.13 
 
 
411 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
410 aa  100  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  24.69 
 
 
403 aa  99.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  24.69 
 
 
403 aa  99.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  26.34 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  23.84 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.05 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  23.53 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  27.79 
 
 
400 aa  96.7  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.44 
 
 
409 aa  95.5  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  24.33 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  24.68 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  24.62 
 
 
397 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
408 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  25.46 
 
 
410 aa  89.7  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  23.61 
 
 
396 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  26.25 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 
421 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  28.31 
 
 
433 aa  87  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  23.44 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  24.15 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  24.15 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.15 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.86 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.86 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  23.86 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.22 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 
410 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.22 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.22 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  23.61 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  23.62 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  23.61 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  23.58 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  23.61 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.43 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  21.97 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  25.06 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  24.19 
 
 
454 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  24.19 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  24.19 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  24.19 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  22.58 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  23.92 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  19.71 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  22.32 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.09 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>