More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0371 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0371  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 
245 aa  500  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  57.02 
 
 
253 aa  299  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  56.61 
 
 
253 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  56.38 
 
 
265 aa  292  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 
244 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 
245 aa  286  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 
245 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 
245 aa  285  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
244 aa  285  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
244 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
244 aa  284  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  57.5 
 
 
244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.68 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  53.47 
 
 
245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  52.65 
 
 
245 aa  280  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  54.92 
 
 
245 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 
244 aa  276  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0374  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.37 
 
 
257 aa  276  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.293894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
245 aa  275  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  53.53 
 
 
241 aa  271  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.36 
 
 
241 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.11 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.79 
 
 
240 aa  268  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  51.6 
 
 
256 aa  268  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  51.67 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  53.88 
 
 
247 aa  265  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
244 aa  264  8e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  52.21 
 
 
259 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.19 
 
 
240 aa  263  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  53.01 
 
 
258 aa  262  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.96 
 
 
240 aa  262  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.79 
 
 
240 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0139  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.03 
 
 
260 aa  261  8.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  52.48 
 
 
240 aa  260  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
240 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.48 
 
 
244 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.28 
 
 
244 aa  259  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  53.11 
 
 
242 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  53.94 
 
 
240 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  53.11 
 
 
242 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  51.45 
 
 
241 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  51.45 
 
 
241 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  51.45 
 
 
241 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 
240 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  52.07 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  52.48 
 
 
242 aa  258  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  53.28 
 
 
247 aa  258  8e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 
248 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  50.41 
 
 
240 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 
240 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.87 
 
 
240 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 
240 aa  257  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.87 
 
 
240 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.42 
 
 
263 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 
240 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.06 
 
 
247 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  52.28 
 
 
241 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  50.62 
 
 
248 aa  256  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 
240 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 
240 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  51.04 
 
 
241 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  50.6 
 
 
256 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 
240 aa  255  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  53.5 
 
 
256 aa  255  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  52.07 
 
 
241 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.2 
 
 
247 aa  255  5e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 
241 aa  254  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  50.62 
 
 
241 aa  254  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  50.62 
 
 
241 aa  254  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  52.7 
 
 
248 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  50.62 
 
 
241 aa  254  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  51.25 
 
 
243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  51.04 
 
 
241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  51.45 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  51.25 
 
 
243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  51.45 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  52.07 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 
243 aa  253  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  51.85 
 
 
245 aa  252  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  51.87 
 
 
240 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  51.43 
 
 
255 aa  252  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  51.21 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  52.28 
 
 
242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  51.87 
 
 
244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  50 
 
 
273 aa  251  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  51 
 
 
259 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.24 
 
 
247 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  49.8 
 
 
264 aa  251  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0670  ABC transporter related  48.75 
 
 
246 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  52.7 
 
 
257 aa  251  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.72 
 
 
239 aa  251  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.2 
 
 
567 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.9 
 
 
273 aa  251  9.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  50.2 
 
 
271 aa  251  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>