265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0363 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  100 
 
 
68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  66.18 
 
 
68 aa  84  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  65.08 
 
 
65 aa  80.9  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  53.03 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  54.41 
 
 
68 aa  75.5  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0737  transcriptional regulator, XRE family  59.38 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  53.97 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 
69 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
69 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 
73 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 
72 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  47.54 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  55 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  55 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 
64 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  51.47 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  51.47 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  51.47 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  51.47 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  54.69 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 
71 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  51.47 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  51.47 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  53.33 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  51.52 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  53.12 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 
63 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  53.33 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  44.26 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  44.26 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  44.26 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  44.26 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  44.26 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  44.26 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  44.26 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  43.08 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  44.26 
 
 
70 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  44.26 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  51.61 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  55.56 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  53.97 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  53.23 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  44.83 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  44.83 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  44.83 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  53.33 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  53.45 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  50 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 
74 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  53.23 
 
 
65 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 
70 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  50.82 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  50.82 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  56.67 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  50.82 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  50.82 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  50.82 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4879  XRE family transcriptional regulator  51.72 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
70 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  51.67 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 
72 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 
69 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  44.93 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  46.77 
 
 
72 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
68 aa  60.1  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  45.16 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  51.56 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  36.36 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  48.39 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  48.39 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  46.77 
 
 
72 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  49.21 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  48.39 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  48.39 
 
 
66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>