More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0361 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  100 
 
 
297 aa  611  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  61.15 
 
 
309 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  53.06 
 
 
309 aa  330  1e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.67 
 
 
298 aa  268  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  42.27 
 
 
299 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.91 
 
 
299 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  39.8 
 
 
299 aa  248  8e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  39.8 
 
 
299 aa  248  8e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  38.23 
 
 
299 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  39.12 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  39.1 
 
 
298 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  37.29 
 
 
406 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  36.79 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  37.02 
 
 
296 aa  211  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
308 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
296 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  36.03 
 
 
305 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
294 aa  208  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  34.69 
 
 
292 aa  208  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  39.1 
 
 
294 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
294 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
318 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  38.06 
 
 
294 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
294 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  34.58 
 
 
292 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  38.41 
 
 
303 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 
309 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 
303 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 
294 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  36.91 
 
 
293 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 
303 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 
294 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 
294 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 
303 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  36.95 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  36.15 
 
 
321 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  35.93 
 
 
295 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  34.78 
 
 
304 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  35.17 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  32.67 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  35.47 
 
 
298 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  34.83 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.58 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  33 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  35.4 
 
 
298 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  33.33 
 
 
309 aa  193  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.91 
 
 
291 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  34.71 
 
 
300 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  35.22 
 
 
305 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  34.81 
 
 
341 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  32.76 
 
 
305 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  35.02 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  31.4 
 
 
303 aa  188  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  32.78 
 
 
326 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  33.22 
 
 
297 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  34.69 
 
 
317 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  35.6 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  32.54 
 
 
294 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  35.66 
 
 
294 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  37.66 
 
 
315 aa  175  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  36.07 
 
 
293 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  35.93 
 
 
316 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  35.75 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  38.21 
 
 
293 aa  165  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  37.95 
 
 
243 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  37.5 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  36.52 
 
 
306 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  35.04 
 
 
266 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  32.18 
 
 
318 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
251 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  33.61 
 
 
332 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  31.06 
 
 
295 aa  155  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  36.79 
 
 
279 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  37.05 
 
 
241 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  29.53 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  34.39 
 
 
369 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  35.68 
 
 
295 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  29.8 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  33.06 
 
 
298 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
341 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  34.22 
 
 
244 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  28.19 
 
 
337 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  36.28 
 
 
300 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  30.29 
 
 
317 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  32.77 
 
 
329 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  29.87 
 
 
316 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  32.3 
 
 
244 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  30.94 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3577  ABC transporter related  29.25 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  31.34 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  32.74 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  32.74 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  32.89 
 
 
244 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  33.78 
 
 
241 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  33.78 
 
 
250 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  29.9 
 
 
310 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>