101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0340 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0340  UspA family nucleotide-binding protein  100 
 
 
155 aa  315  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  2.38748e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1791  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  42.47 
 
 
168 aa  113  1e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D31  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  39.72 
 
 
145 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.575009  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1794  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.14 
 
 
148 aa  103  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1510  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
158 aa  87  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.285079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
152 aa  70.5  8e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  35.62 
 
 
166 aa  70.1  9e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
152 aa  70.1  1e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  36.81 
 
 
152 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  36.81 
 
 
152 aa  69.7  2e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  36.81 
 
 
152 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  36.81 
 
 
152 aa  69.7  2e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  36.81 
 
 
152 aa  69.7  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  36.81 
 
 
152 aa  69.7  2e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  36.81 
 
 
152 aa  69.7  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  36.81 
 
 
152 aa  69.7  2e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  36.81 
 
 
152 aa  69.7  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  34.97 
 
 
148 aa  67.8  6e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
166 aa  66.2  1e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
166 aa  66.2  1e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.41 
 
 
145 aa  60.5  9e-09  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
164 aa  59.7  2e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  31.47 
 
 
150 aa  59.3  2e-08  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  28.97 
 
 
150 aa  55.5  3e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  29.37 
 
 
150 aa  53.9  8e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  29.33 
 
 
164 aa  52.8  2e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  28.28 
 
 
149 aa  52  3e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.17 
 
 
138 aa  51.6  4e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.21 
 
 
154 aa  51.2  5e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  31.94 
 
 
147 aa  50.8  7e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  33.56 
 
 
147 aa  50.1  1e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  28.67 
 
 
141 aa  50.1  1e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  31.79 
 
 
143 aa  48.9  2e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.25 
 
 
143 aa  49.7  2e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.97 
 
 
142 aa  49.7  2e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  48.9  3e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  28.28 
 
 
147 aa  48.9  3e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.13 
 
 
147 aa  47.8  6e-05  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  30.5 
 
 
138 aa  47.8  6e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  29.22 
 
 
148 aa  47  9e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  24.66 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.06197e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  29.53 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  32.21 
 
 
187 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  48.15 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  29.94 
 
 
295 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.62 
 
 
291 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  32.67 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  28.38 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  28.16 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  28.77 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  33.33 
 
 
296 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  29.8 
 
 
305 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  28.08 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  28.77 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  32 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  31.79 
 
 
305 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  28.47 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  29.53 
 
 
317 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  25.9 
 
 
271 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  31.97 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
275 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  29.03 
 
 
321 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  9.30123e-07 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.63 
 
 
156 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  32.17 
 
 
304 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  28.28 
 
 
152 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  28.76 
 
 
161 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  29.17 
 
 
143 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  28.76 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.34 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.24283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.25 
 
 
305 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  28.39 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  27.7 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  32.89 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  29.53 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.97 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  26.67 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  30.07 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  29.05 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  30.07 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  26.95 
 
 
280 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.52 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  26.85 
 
 
144 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  26.85 
 
 
144 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  26.85 
 
 
144 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  26.85 
 
 
144 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0837729 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>