More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0331 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  54.65 
 
 		 660 aa  676    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  50.52 
 
 		 664 aa  639    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 		 662 aa  1340    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  51.86 
 
 		 664 aa  628  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  35.07 
 
 		 643 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  30.37 
 
 		 653 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  30.2 
 
 		 678 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.2 
 
 		 678 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  30.48 
 
 		 678 aa  266  8e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.82 
 
 		 648 aa  263  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  30.48 
 
 		 667 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  29.1 
 
 		 651 aa  263  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  30.48 
 
 		 667 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  30.32 
 
 		 656 aa  262  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.42 
 
 		 656 aa  261  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  29.5 
 
 		 649 aa  261  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  29.99 
 
 		 682 aa  260  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  29.23 
 
 		 652 aa  259  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.31 
 
 		 647 aa  259  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  29.73 
 
 		 652 aa  259  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  32.17 
 
 		 671 aa  258  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.45 
 
 		 649 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  29.72 
 
 		 668 aa  257  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  29.71 
 
 		 682 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  29.2 
 
 		 650 aa  256  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  40.56 
 
 		 779 aa  256  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.99 
 
 		 648 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.3 
 
 		 649 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  29.84 
 
 		 648 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  29.52 
 
 		 648 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  29.52 
 
 		 648 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.02 
 
 		 661 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  29.84 
 
 		 648 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.84 
 
 		 648 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  29.84 
 
 		 648 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.84 
 
 		 648 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.69 
 
 		 648 aa  253  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  31.27 
 
 		 668 aa  253  9.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.69 
 
 		 648 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  29.15 
 
 		 650 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  29.64 
 
 		 644 aa  253  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  30.03 
 
 		 652 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  30.54 
 
 		 663 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.52 
 
 		 653 aa  250  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  31.29 
 
 		 663 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  28.74 
 
 		 648 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  27.99 
 
 		 696 aa  249  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  30.27 
 
 		 668 aa  248  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  30.27 
 
 		 668 aa  248  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  30.14 
 
 		 657 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  30.13 
 
 		 656 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.17 
 
 		 654 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  31.11 
 
 		 645 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  28.93 
 
 		 646 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  29.66 
 
 		 654 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  28.82 
 
 		 653 aa  243  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  29.2 
 
 		 657 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.34 
 
 		 641 aa  242  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  30.14 
 
 		 657 aa  242  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.05 
 
 		 646 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  26.23 
 
 		 687 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.66 
 
 		 653 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  29.45 
 
 		 654 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  46.62 
 
 		 1130 aa  237  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  26.73 
 
 		 681 aa  237  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  26.87 
 
 		 681 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  29.4 
 
 		 643 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  29.69 
 
 		 643 aa  234  4.0000000000000004e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.49 
 
 		 653 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.49 
 
 		 653 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.49 
 
 		 653 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  42.41 
 
 		 1090 aa  233  9e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  29.26 
 
 		 658 aa  233  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  29.83 
 
 		 654 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  28.49 
 
 		 655 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  39.02 
 
 		 779 aa  231  3e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  27.3 
 
 		 666 aa  231  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  29.77 
 
 		 676 aa  231  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  28.65 
 
 		 657 aa  230  7e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  42.57 
 
 		 950 aa  229  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.01 
 
 		 888 aa  229  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  45.32 
 
 		 903 aa  228  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  29.77 
 
 		 647 aa  225  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.32 
 
 		 665 aa  224  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  28.64 
 
 		 660 aa  223  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.3 
 
 		 651 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  28.2 
 
 		 670 aa  221  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  27.45 
 
 		 650 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  39.66 
 
 		 885 aa  220  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  46.58 
 
 		 228 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.32 
 
 		 226 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.61 
 
 		 230 aa  216  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 226 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  36.77 
 
 		 654 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  28.1 
 
 		 657 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  38.96 
 
 		 653 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.74 
 
 		 230 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 		 226 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  48.2 
 
 		 233 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  37.5 
 
 		 647 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>