More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0311 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  100 
 
 
321 aa  643    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  60.58 
 
 
318 aa  370  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  54.25 
 
 
316 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.82 
 
 
313 aa  322  8e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  55.23 
 
 
319 aa  310  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  54.9 
 
 
321 aa  310  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  52.29 
 
 
316 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  51.3 
 
 
314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.86 
 
 
316 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.32 
 
 
315 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  50 
 
 
323 aa  293  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  52.68 
 
 
315 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  54.37 
 
 
314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.37 
 
 
314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  46.84 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.29 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  52.98 
 
 
320 aa  276  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  47.4 
 
 
326 aa  276  4e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.74 
 
 
313 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.69 
 
 
317 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.42 
 
 
325 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  46.31 
 
 
323 aa  250  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.23 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  43.18 
 
 
314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1961  dioxygenase  38.78 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  42.86 
 
 
313 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  41.42 
 
 
311 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.92 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.81 
 
 
334 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.1 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.27 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.78 
 
 
313 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.42 
 
 
323 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.86 
 
 
329 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.18 
 
 
319 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.84 
 
 
331 aa  189  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.06 
 
 
326 aa  189  8e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.77 
 
 
319 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.81 
 
 
314 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.26 
 
 
316 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.94 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.74 
 
 
324 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.06 
 
 
338 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.16 
 
 
331 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.46 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.39 
 
 
328 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.08 
 
 
328 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.94 
 
 
325 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.34 
 
 
331 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.46 
 
 
355 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.46 
 
 
355 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.58 
 
 
342 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.42 
 
 
324 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.1 
 
 
323 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.86 
 
 
312 aa  178  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.05 
 
 
331 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.44 
 
 
325 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.02 
 
 
354 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.42 
 
 
319 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.94 
 
 
323 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  38.92 
 
 
334 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.29 
 
 
342 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.48 
 
 
324 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.39 
 
 
328 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.48 
 
 
324 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.16 
 
 
332 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.93 
 
 
345 aa  176  7e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.65 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.51 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  33.54 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  35.48 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.98 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.44 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.77 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.13 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.58 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.82 
 
 
324 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.39 
 
 
327 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.54 
 
 
332 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  36 
 
 
316 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.38 
 
 
305 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.67 
 
 
330 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.89 
 
 
325 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  36.86 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.06 
 
 
334 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.94 
 
 
332 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.94 
 
 
332 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.94 
 
 
332 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.38 
 
 
378 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.22 
 
 
325 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.33 
 
 
328 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.61 
 
 
380 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.05 
 
 
354 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.88 
 
 
326 aa  159  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  31.73 
 
 
365 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  32.93 
 
 
364 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.46 
 
 
327 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.42 
 
 
386 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  31.44 
 
 
364 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  31.44 
 
 
364 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>