More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0308 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  314  3e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  26.56 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  26.71 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  22.9 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.97 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  21.82 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  20.91 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>