More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0279 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  55.07 
 
 
213 aa  242  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  58.67 
 
 
210 aa  232  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  55.39 
 
 
214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  51.43 
 
 
208 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  50.95 
 
 
208 aa  226  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  50.95 
 
 
208 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  50.48 
 
 
208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  50.48 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  50.48 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  50.48 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  50.48 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  50.48 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  50.48 
 
 
208 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  52.86 
 
 
213 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  49.05 
 
 
208 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  52.74 
 
 
211 aa  216  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  49.51 
 
 
217 aa  203  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  47.85 
 
 
209 aa  199  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  48.78 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  48.78 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  52.04 
 
 
203 aa  190  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  45.69 
 
 
211 aa  184  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43.2 
 
 
210 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  43.69 
 
 
210 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  43.2 
 
 
207 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  43.69 
 
 
210 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  43.69 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  44.44 
 
 
671 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.83 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  43.2 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  45.83 
 
 
216 aa  171  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  45.15 
 
 
210 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  41.04 
 
 
225 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  42.38 
 
 
686 aa  168  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  44.95 
 
 
217 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.95 
 
 
216 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  43.54 
 
 
209 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  45.79 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  44.17 
 
 
686 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  40.89 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  41.35 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  48.88 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.68 
 
 
707 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  41.31 
 
 
211 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.03 
 
 
703 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  42.65 
 
 
688 aa  162  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  40.19 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  46.35 
 
 
205 aa  161  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  41.18 
 
 
200 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  41.9 
 
 
207 aa  161  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  41.26 
 
 
210 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.35 
 
 
221 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.78 
 
 
212 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  41.67 
 
 
208 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  41.26 
 
 
210 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  38.76 
 
 
206 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  43.16 
 
 
688 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.03 
 
 
705 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  40.67 
 
 
224 aa  159  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.04 
 
 
207 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  43.08 
 
 
219 aa  158  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.51 
 
 
205 aa  158  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  42.71 
 
 
214 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  44.62 
 
 
203 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.62 
 
 
213 aa  158  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  40.19 
 
 
211 aa  157  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  45.54 
 
 
210 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  40.76 
 
 
219 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  39.25 
 
 
224 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  43.01 
 
 
223 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  40.48 
 
 
234 aa  155  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  39.71 
 
 
214 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  42.71 
 
 
223 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  45.16 
 
 
211 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  42.63 
 
 
210 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.36 
 
 
215 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  37.86 
 
 
236 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  35.98 
 
 
225 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  38.28 
 
 
218 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  45.92 
 
 
212 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  39.81 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  37.86 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  40.1 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  39.7 
 
 
901 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  40.93 
 
 
203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  40.31 
 
 
232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  42.93 
 
 
225 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  40.1 
 
 
203 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  40 
 
 
281 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  39.13 
 
 
221 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  37.14 
 
 
221 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  37.62 
 
 
215 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  40 
 
 
204 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  39.38 
 
 
226 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  40.09 
 
 
216 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  40.67 
 
 
243 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  39.2 
 
 
209 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  37.62 
 
 
234 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  40 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>