More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0271 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 178 aa  350  5e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  65.36 
 
 		 197 aa  232  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  57.49 
 
 		 167 aa  187  8e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  57.93 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  53.89 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  53.66 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  53.66 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  53.66 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  53.66 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  53.66 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  53.66 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  55.21 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  53.66 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  53.66 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  55.21 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  53.05 
 
 		 166 aa  174  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  52.44 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  51.83 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  53.57 
 
 		 171 aa  162  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  49.06 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  47.8 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  47.8 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  47.56 
 
 		 170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  46.39 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 166 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 166 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  43.04 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  42.6 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  42 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  37.93 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  37.89 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  41.14 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  40 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 166 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  44.29 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  44.7 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  38 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  47.66 
 
 		 203 aa  104  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  37.09 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  38.61 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  40.52 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  46.21 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  42.22 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.07 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  37.99 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  38.06 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  38.12 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  42.42 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2868  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000140329  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  43.88 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 165 aa  99.4  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  39.11 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  36.17 
 
 		 176 aa  99  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  39.1 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  35.46 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  37.2 
 
 		 200 aa  98.2  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2728  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 162 aa  98.2  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  34.13 
 
 		 175 aa  97.8  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 256 aa  97.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>