More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0268 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  60.54 
 
 
180 aa  234  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  58.92 
 
 
185 aa  228  5e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  55.61 
 
 
182 aa  214  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  55.61 
 
 
182 aa  214  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  55.08 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  54.95 
 
 
177 aa  207  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  52.17 
 
 
181 aa  197  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  53.85 
 
 
177 aa  197  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  52.97 
 
 
183 aa  193  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  50 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  54.95 
 
 
177 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  50.56 
 
 
175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  48.35 
 
 
175 aa  178  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  49.45 
 
 
174 aa  178  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  53.85 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  53.85 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  53.85 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  53.85 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  53.85 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  53.85 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  53.85 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  53.85 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  53.85 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  48.35 
 
 
185 aa  174  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  41.76 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  49.15 
 
 
188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  47.78 
 
 
187 aa  171  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  50 
 
 
175 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  48.62 
 
 
175 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  48.11 
 
 
179 aa  168  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  47.22 
 
 
194 aa  167  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  46.24 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  48.09 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  46.67 
 
 
194 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  48.11 
 
 
179 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  44.75 
 
 
178 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  47.31 
 
 
178 aa  159  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  48.88 
 
 
173 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  48.88 
 
 
173 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  42.93 
 
 
280 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  44.75 
 
 
201 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  43.89 
 
 
172 aa  154  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  42.86 
 
 
176 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  40.82 
 
 
238 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  39.9 
 
 
198 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  39.89 
 
 
306 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  47.03 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  41.99 
 
 
185 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  41.99 
 
 
177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  41.27 
 
 
266 aa  151  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  45.56 
 
 
177 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  42.93 
 
 
181 aa  150  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  41.62 
 
 
238 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  41.99 
 
 
177 aa  149  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  41.44 
 
 
177 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  39.29 
 
 
272 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  43.48 
 
 
185 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  45.6 
 
 
174 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  39.67 
 
 
266 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  38.89 
 
 
266 aa  147  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  40.54 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  40.31 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  43.41 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  38.58 
 
 
270 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  38.58 
 
 
270 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  38.58 
 
 
271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  40.76 
 
 
199 aa  144  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  38.19 
 
 
267 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  37.25 
 
 
276 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  36.87 
 
 
299 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  40.43 
 
 
273 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  40.54 
 
 
177 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  37.37 
 
 
273 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  41.44 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  37.37 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  38.67 
 
 
176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  40.33 
 
 
174 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  40.88 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  40 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  40.88 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  38.8 
 
 
177 aa  138  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  38.67 
 
 
176 aa  137  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  41.34 
 
 
190 aa  137  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  41.76 
 
 
193 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>