More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0217 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0217  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
71 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.425198  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  86.57 
 
 
83 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  83.82 
 
 
72 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
72 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  79.71 
 
 
72 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  85.29 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  79.71 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  78.26 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  85.29 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  79.71 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  80.88 
 
 
73 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  78.26 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  79.41 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  76.47 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  73.91 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  75.36 
 
 
72 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  73.91 
 
 
72 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  77.94 
 
 
72 aa  113  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  75.36 
 
 
73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0616  translation initiation factor 1  81.43 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 
74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 
74 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 
74 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 
74 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  75.76 
 
 
72 aa  110  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  75.36 
 
 
72 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  71.01 
 
 
72 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  71.01 
 
 
72 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  75.36 
 
 
72 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 
72 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  73.53 
 
 
85 aa  110  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 
72 aa  110  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  74.24 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  72.46 
 
 
72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  75.76 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  72.46 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  70.59 
 
 
73 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 
72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  72.06 
 
 
72 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  75.76 
 
 
73 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 
72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  69.12 
 
 
87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 
72 aa  107  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  70.59 
 
 
72 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 
72 aa  107  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 
72 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 
72 aa  107  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 
72 aa  107  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  71.64 
 
 
72 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1729  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
73 aa  107  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  68.66 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 
78 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 
78 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  106  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  71.21 
 
 
73 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  72.73 
 
 
72 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  69.7 
 
 
72 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
73 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 
72 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
73 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 
72 aa  105  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 
72 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3352  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0756524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 
72 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 
72 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 
72 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 
72 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 
72 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 
72 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 
72 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 
72 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 
72 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 
72 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  69.57 
 
 
73 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 
72 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>