170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0213 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
60 aa  119  1e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  3.48111e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  79.66 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  71.93 
 
 
60 aa  87  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  65 
 
 
60 aa  81.6  4e-15  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.01439e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  55 
 
 
60 aa  66.6  1e-10  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 
59 aa  65.5  2e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  54.39 
 
 
62 aa  62.8  1e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 
59 aa  62.8  2e-09  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  50.85 
 
 
59 aa  60.5  7e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 
61 aa  57.4  6e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  1.28267e-05  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  47.46 
 
 
60 aa  57.4  7e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 
63 aa  55.8  2e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  44.07 
 
 
59 aa  55.8  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  8.36724e-05  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
59 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  44.07 
 
 
60 aa  55.5  3e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 
61 aa  54.7  4e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  6.57277e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 
59 aa  54.7  4e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  44.26 
 
 
62 aa  54.3  5e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  45 
 
 
60 aa  54.3  5e-07  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  54.7  5e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  42.86 
 
 
63 aa  54.7  5e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  54.7  5e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  42.37 
 
 
60 aa  53.9  8e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  49.15 
 
 
61 aa  53.5  9e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 
60 aa  53.5  1e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 
61 aa  53.5  1e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  43.33 
 
 
60 aa  53.1  1e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
59 aa  53.1  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.0093e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 
60 aa  52.8  2e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  8.66459e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 
62 aa  52.4  2e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  44.07 
 
 
60 aa  52.4  2e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
61 aa  52.8  2e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
61 aa  52.8  2e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  45 
 
 
61 aa  52.4  2e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  4.49635e-09  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  45 
 
 
60 aa  52.4  2e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  45 
 
 
60 aa  52  2e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  45.76 
 
 
60 aa  52.8  2e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
75 aa  52.4  2e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  6.50866e-05 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  45.9 
 
 
61 aa  52  3e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 
65 aa  51.6  4e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.07725e-06  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  40 
 
 
60 aa  51.2  4e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  44.07 
 
 
59 aa  51.2  4e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 
60 aa  51.6  4e-06  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  43.33 
 
 
60 aa  50.8  5e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 
59 aa  51.2  5e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  42.37 
 
 
60 aa  50.8  5e-06  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 
66 aa  50.8  6e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  42.37 
 
 
60 aa  50.8  6e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 
78 aa  49.7  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  45.61 
 
 
61 aa  49.7  1e-05  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  2.5708e-07  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  42.37 
 
 
60 aa  49.7  1e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 
65 aa  49.7  1e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  42.11 
 
 
58 aa  49.7  1e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  7.5211e-08 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 
60 aa  50.1  1e-05  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.19229e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 
61 aa  50.1  1e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
61 aa  49.7  1e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 
61 aa  49.3  2e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 
62 aa  49.3  2e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 
60 aa  49.3  2e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  40 
 
 
63 aa  48.5  3e-05  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  1.67701e-05 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 
61 aa  48.5  3e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 
59 aa  48.5  3e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  41.67 
 
 
60 aa  47.8  6e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 
62 aa  47.4  6e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  41.67 
 
 
60 aa  47.4  6e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  47.4  7e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.62232e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  47.4  7e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.814e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  47.4  7e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.37518e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  47.4  7e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  47.4  7e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  47.4  7e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  47.4  7e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.11905e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  47.4  7e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  37.93 
 
 
58 aa  47  8e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  37.93 
 
 
58 aa  47  8e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.99402e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  40 
 
 
61 aa  47  9e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 
62 aa  47  9e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.87774e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  38.98 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  40.98 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.89447e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0444  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.47564e-07  hitchhiker  9.3478e-05 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  37.93 
 
 
58 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  8.60316e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.2367e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  40 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  38.18 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  41.82 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.91615e-05  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  40 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  40 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.38401e-09  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  42.86 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  41.67 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  2.84143e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  40 
 
 
59 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  39.29 
 
 
59 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  38.18 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.79323e-06  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  41.82 
 
 
59 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  40 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  40 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  40 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>