More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0212 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
168 aa  328  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  3.16e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  77.3 
 
 
165 aa  256  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  72.89 
 
 
169 aa  247  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.30874e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  70.99 
 
 
166 aa  231  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  70.37 
 
 
166 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  223  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  221  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  221  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.26666e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  221  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.28927e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  221  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.95354e-09  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  221  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  221  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.20585e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  221  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.3601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  221  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  69.14 
 
 
166 aa  221  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  67.27 
 
 
166 aa  220  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.348e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  74.07 
 
 
168 aa  207  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  65.43 
 
 
164 aa  206  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0307  30S ribosomal protein S5  70.95 
 
 
174 aa  204  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  61.21 
 
 
167 aa  202  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.09593e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  64.94 
 
 
173 aa  201  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  73.08 
 
 
164 aa  201  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  63.29 
 
 
166 aa  201  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  201  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  65.33 
 
 
166 aa  200  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  61.73 
 
 
168 aa  200  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.23427e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  65.33 
 
 
166 aa  199  1e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  65.33 
 
 
166 aa  199  1e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1890  30S ribosomal protein S5  73.08 
 
 
164 aa  199  2e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 
165 aa  196  1e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 
165 aa  196  1e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  63.23 
 
 
166 aa  192  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  63.51 
 
 
206 aa  191  4e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  60.87 
 
 
168 aa  189  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  60.65 
 
 
166 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
167 aa  186  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 
166 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.49284e-05  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  60.65 
 
 
168 aa  185  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
163 aa  184  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  58.71 
 
 
169 aa  184  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  57.5 
 
 
163 aa  184  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  58.02 
 
 
166 aa  183  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 
163 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  181  4e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
163 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  58.33 
 
 
169 aa  178  3e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  55.77 
 
 
175 aa  177  6e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 
189 aa  177  8e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  5.15856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  60.13 
 
 
172 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  60.4 
 
 
169 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 
174 aa  175  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  60.4 
 
 
169 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  58.06 
 
 
180 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  8.76107e-05  hitchhiker  7.86108e-05 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  60.4 
 
 
169 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  57.05 
 
 
173 aa  175  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  1.46915e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  56.6 
 
 
162 aa  175  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  52.6 
 
 
172 aa  174  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.52788e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  57.42 
 
 
180 aa  174  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 
173 aa  174  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 
162 aa  174  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.75279e-06  hitchhiker  1.14757e-07 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 
172 aa  172  2e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.67346e-08  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  56.41 
 
 
167 aa  172  2e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  54.6 
 
 
194 aa  171  3e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 
172 aa  171  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 
172 aa  171  6e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.5537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  55 
 
 
189 aa  170  7e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  51.83 
 
 
179 aa  170  8e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  56.38 
 
 
166 aa  170  8e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 
172 aa  169  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  55.26 
 
 
162 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  52.76 
 
 
174 aa  169  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  57.89 
 
 
197 aa  169  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  55.77 
 
 
168 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  8.74802e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  57.52 
 
 
202 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  57.52 
 
 
202 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 
162 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  56.25 
 
 
168 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
162 aa  168  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
162 aa  168  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.04124e-09 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  52.23 
 
 
172 aa  168  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  56.38 
 
 
182 aa  168  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 
166 aa  167  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  52.23 
 
 
172 aa  168  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  52.2 
 
 
179 aa  167  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  6.6757e-06 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 
171 aa  167  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  57.52 
 
 
210 aa  167  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0679  30S ribosomal protein S5  62.16 
 
 
254 aa  167  9e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  50.94 
 
 
166 aa  167  9e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 
162 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  51.59 
 
 
167 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.99413e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  50.32 
 
 
234 aa  166  1e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  52.63 
 
 
163 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  57.52 
 
 
189 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  51.57 
 
 
166 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
186 aa  165  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
189 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  51.57 
 
 
166 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  51.57 
 
 
166 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 
172 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 
167 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>