More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0204 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
68 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  69.7 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  67.16 
 
 
68 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  69.35 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  72.41 
 
 
68 aa  80.5  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  64.52 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  61.29 
 
 
64 aa  77.4  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  61.29 
 
 
64 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  60.66 
 
 
65 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  57.81 
 
 
71 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  59.68 
 
 
71 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 
69 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  62.5 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  60.94 
 
 
68 aa  73.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  59.02 
 
 
77 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  60.66 
 
 
77 aa  72.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  56.06 
 
 
67 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  56.45 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  60.94 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  60.94 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  60.66 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  59.02 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 
62 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  54.84 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  54.39 
 
 
62 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  63.16 
 
 
62 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  58.93 
 
 
62 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  54.39 
 
 
62 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  58.93 
 
 
67 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  57.81 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  48.44 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  57.81 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  57.81 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  50.72 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  56.72 
 
 
78 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  56.25 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  57.38 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  52.17 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  57.38 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  56.36 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  56.45 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  52.46 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  52.24 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  50 
 
 
76 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  57.89 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  56.45 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  55.17 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  71.43 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  57.89 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  68.18 
 
 
84 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 
77 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  63.46 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  54.1 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  46.88 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  46.43 
 
 
62 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  52.46 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  52.24 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  53.45 
 
 
68 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  53.45 
 
 
68 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  52.46 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  49.09 
 
 
63 aa  61.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  69.05 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  66.67 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  58.18 
 
 
70 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  69.05 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  46.77 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  54.39 
 
 
63 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  58.49 
 
 
68 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>