More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0200 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0200  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 92 aa  189  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.130861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  83.33 
 
 		 92 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  83.33 
 
 		 92 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 		 92 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  81.11 
 
 		 92 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  84.44 
 
 		 95 aa  159  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0599  SSU ribosomal protein S19P  82.8 
 
 		 93 aa  156  7e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  83.33 
 
 		 92 aa  156  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  83.33 
 
 		 92 aa  156  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  83.33 
 
 		 92 aa  156  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  78.89 
 
 		 92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  78.89 
 
 		 92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  76.67 
 
 		 92 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  76.67 
 
 		 92 aa  148  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  76.67 
 
 		 92 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  74.44 
 
 		 93 aa  143  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  74.16 
 
 		 87 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  138  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 		 93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 		 93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 		 93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 93 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  70 
 
 		 93 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  75.28 
 
 		 91 aa  136  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  71.11 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  70 
 
 		 93 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 		 94 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 93 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 94 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  70 
 
 		 93 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 95 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 94 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  67.78 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 93 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 94 aa  130  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 91 aa  130  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  69.32 
 
 		 91 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  69.66 
 
 		 93 aa  130  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 		 91 aa  129  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  69.66 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  67.05 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  69.66 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  68.54 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>