More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0189 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  57.3 
 
 
704 aa  794    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  57.3 
 
 
704 aa  794    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0721  elongation factor G  55.7 
 
 
694 aa  795    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.062401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  62.39 
 
 
692 aa  889    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  57.37 
 
 
703 aa  823    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  69.09 
 
 
693 aa  992    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  57.39 
 
 
698 aa  820    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  56.92 
 
 
703 aa  808    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0804  elongation factor G  56.81 
 
 
700 aa  789    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.0692379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  69.24 
 
 
692 aa  1000    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  57.94 
 
 
699 aa  815    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  57.55 
 
 
691 aa  828    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  71.24 
 
 
692 aa  1023    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1236  elongation factor G  57.93 
 
 
694 aa  791    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0596578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  59.11 
 
 
698 aa  826    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0623  translation elongation factor G  56.57 
 
 
701 aa  803    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  69.38 
 
 
692 aa  1002    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  69.38 
 
 
692 aa  1002    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl622  elongation factor G  63.18 
 
 
689 aa  895    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  69.24 
 
 
692 aa  1002    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  55.78 
 
 
700 aa  802    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  57.95 
 
 
694 aa  815    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  57.8 
 
 
694 aa  813    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4551  elongation factor G  56 
 
 
701 aa  796    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  57.7 
 
 
697 aa  811    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  57 
 
 
704 aa  803    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  56.7 
 
 
702 aa  809    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5535  elongation factor G  57.16 
 
 
701 aa  788    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.873781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  57.2 
 
 
696 aa  814    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  56.43 
 
 
692 aa  797    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  55.78 
 
 
700 aa  802    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  58.82 
 
 
697 aa  831    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5082  elongation factor G  56 
 
 
701 aa  802    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000061463  normal  0.350289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1708  elongation factor G  58.4 
 
 
705 aa  815    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  59.8 
 
 
692 aa  863    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  56.61 
 
 
700 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  57.88 
 
 
701 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  57.95 
 
 
704 aa  824    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  55.32 
 
 
691 aa  791    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  57.71 
 
 
704 aa  834    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  55.03 
 
 
691 aa  794    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  62.39 
 
 
692 aa  887    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0292  translation elongation factor G  57.2 
 
 
700 aa  806    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000300154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  69.38 
 
 
692 aa  1002    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  55.32 
 
 
691 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  57.14 
 
 
694 aa  803    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  57.49 
 
 
696 aa  813    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0153  elongation factor G  62.46 
 
 
689 aa  891    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  59.22 
 
 
692 aa  825    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  61.76 
 
 
692 aa  890    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  55.78 
 
 
700 aa  802    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  58.36 
 
 
697 aa  839    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  58.07 
 
 
698 aa  801    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  55.84 
 
 
690 aa  800    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0577  elongation factor G  56.65 
 
 
706 aa  795    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  57.33 
 
 
700 aa  800    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  59.4 
 
 
701 aa  839    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  56.75 
 
 
697 aa  820    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  56.63 
 
 
700 aa  803    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  56.21 
 
 
704 aa  788    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  55.92 
 
 
700 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  57.74 
 
 
701 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  57.68 
 
 
698 aa  803    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  56.69 
 
 
690 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  56.14 
 
 
706 aa  803    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  56.9 
 
 
703 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  57.16 
 
 
702 aa  789    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  57.86 
 
 
697 aa  852    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  58.61 
 
 
696 aa  818    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0241  elongation factor G  56.51 
 
 
706 aa  798    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449093  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  56.85 
 
 
697 aa  806    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  55.78 
 
 
700 aa  798    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  59.34 
 
 
701 aa  828    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  58.96 
 
 
715 aa  833    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1681  elongation factor G  59.28 
 
 
696 aa  829    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  60.12 
 
 
688 aa  849    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  60.26 
 
 
688 aa  849    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  58.82 
 
 
698 aa  822    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  58.82 
 
 
698 aa  822    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0455  elongation factor G  58.23 
 
 
699 aa  810    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  57.53 
 
 
698 aa  809    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1798  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  59.08 
 
 
691 aa  826    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.287581  normal  0.0715825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  56.75 
 
 
700 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  58.06 
 
 
702 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  80.06 
 
 
702 aa  1185    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  72.93 
 
 
698 aa  1052    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  100 
 
 
703 aa  1434    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  70.67 
 
 
693 aa  1015    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  58.32 
 
 
713 aa  821    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  55.92 
 
 
700 aa  800    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  57.51 
 
 
703 aa  788    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  59 
 
 
692 aa  833    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  58.97 
 
 
698 aa  826    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  57.7 
 
 
691 aa  816    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  59.71 
 
 
692 aa  853    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  57.37 
 
 
704 aa  821    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0755  elongation factor G  57.33 
 
 
707 aa  800    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  56.37 
 
 
703 aa  787    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  58.33 
 
 
698 aa  820    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  59.34 
 
 
701 aa  828    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>