More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0187 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
137 aa  276  9e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  89.05 
 
 
137 aa  247  4e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  86.76 
 
 
137 aa  235  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  85.29 
 
 
140 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 
137 aa  231  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  87.22 
 
 
135 aa  230  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  85.29 
 
 
137 aa  230  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  230  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  230  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  84.56 
 
 
140 aa  230  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  83.94 
 
 
140 aa  227  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  83.82 
 
 
139 aa  228  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  82.35 
 
 
137 aa  226  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  81.75 
 
 
137 aa  225  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 
137 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  81.62 
 
 
137 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  84.73 
 
 
140 aa  221  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  76.64 
 
 
137 aa  207  3e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  77.61 
 
 
146 aa  204  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  76.69 
 
 
135 aa  204  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  78.36 
 
 
151 aa  204  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
145 aa  200  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 
139 aa  199  7e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  75.74 
 
 
142 aa  199  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0614  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000753493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  70.29 
 
 
140 aa  197  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
142 aa  191  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
124 aa  190  5e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
138 aa  190  6e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  73.88 
 
 
144 aa  189  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  73.88 
 
 
144 aa  189  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 
123 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 
123 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
126 aa  186  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
126 aa  186  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
124 aa  186  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
124 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  70.59 
 
 
142 aa  186  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  71.76 
 
 
144 aa  185  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
128 aa  185  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  71.76 
 
 
144 aa  185  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  70.21 
 
 
141 aa  185  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  71.76 
 
 
144 aa  185  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
123 aa  183  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
123 aa  183  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
128 aa  183  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 
137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0290  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000638987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
125 aa  181  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  70.68 
 
 
137 aa  181  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
125 aa  181  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 
124 aa  181  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000473434  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0195  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00503179  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 
125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 
125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4465  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4061  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000816625  hitchhiker  0.00000101857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0191  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00539976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
134 aa  180  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 
124 aa  180  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  180  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 
127 aa  180  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
137 aa  180  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  180  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  70.8 
 
 
124 aa  180  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  70.59 
 
 
135 aa  180  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0226  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
123 aa  179  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0194  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0259871  hitchhiker  0.00000480785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0189  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.019095  decreased coverage  0.000333311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  67.88 
 
 
127 aa  179  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  69.17 
 
 
122 aa  179  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 
123 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
124 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
125 aa  179  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0453  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 
124 aa  179  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
135 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
124 aa  178  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
128 aa  179  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
124 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 
124 aa  178  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
123 aa  178  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
124 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000589821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0275  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 
124 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000516158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>