More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0118 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0118  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  100 
 
 
287 aa  568  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1585  NLPA lipoprotein  59.85 
 
 
287 aa  331  8e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255778  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  37.7 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  36.84 
 
 
284 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  38.55 
 
 
284 aa  169  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36.62 
 
 
284 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36.27 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.92 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  36.62 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  35.44 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  35.79 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  35.44 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.44 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  35.84 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  39.06 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  35.09 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  40.35 
 
 
256 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  39 
 
 
257 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  39.47 
 
 
256 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  39.47 
 
 
256 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  40.35 
 
 
260 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  39.47 
 
 
256 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  37.64 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  37.64 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  41.86 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1054  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  60.83 
 
 
163 aa  152  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  38.79 
 
 
265 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  36.59 
 
 
260 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  36.3 
 
 
260 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0362  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.97 
 
 
287 aa  149  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  38.53 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.8 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  34.91 
 
 
283 aa  145  9e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  34.06 
 
 
271 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  37.85 
 
 
281 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  33.71 
 
 
271 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  36.52 
 
 
284 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  36.52 
 
 
284 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  35.32 
 
 
281 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  35.32 
 
 
272 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  35.32 
 
 
272 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  35.32 
 
 
272 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  35.32 
 
 
272 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  35.32 
 
 
272 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  35.32 
 
 
272 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  34.92 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  34.92 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  34.92 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  35.81 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  34.92 
 
 
271 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  34.92 
 
 
271 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  34.92 
 
 
271 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  36.4 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3533  NLPA lipoprotein  35.29 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.16791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  35.62 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  33.7 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  35.45 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  35.86 
 
 
257 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  35.2 
 
 
286 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  33.7 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  36.52 
 
 
264 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  35.51 
 
 
278 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.95 
 
 
270 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  34.93 
 
 
266 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  31.5 
 
 
265 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  36.84 
 
 
261 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  35.77 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  36.48 
 
 
263 aa  136  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  36.97 
 
 
256 aa  136  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  32.27 
 
 
281 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  35.81 
 
 
261 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  35.81 
 
 
261 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  35.81 
 
 
261 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  35.09 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  35.09 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1370  lipoprotein, YaeC family  32.6 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0640926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  35.09 
 
 
261 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1776  lipoprotein, YaeC family  33.46 
 
 
271 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  31.36 
 
 
288 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  33.59 
 
 
270 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  33.33 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  33.77 
 
 
259 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  34.19 
 
 
257 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  35.58 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  28.67 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  39.04 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  36 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  35.06 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  33.61 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  35.77 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  35.56 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  35.56 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  35.56 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  37.72 
 
 
273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  34.23 
 
 
267 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  32.97 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  35.56 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>