95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0115 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
248 aa  510  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  69.49 
 
 
247 aa  343  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  61.57 
 
 
244 aa  314  7e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  56.07 
 
 
250 aa  267  8.999999999999999e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  56.07 
 
 
250 aa  267  8.999999999999999e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  53.53 
 
 
243 aa  251  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  51.03 
 
 
247 aa  249  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  46.94 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  46.19 
 
 
249 aa  214  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  45.31 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  44 
 
 
251 aa  210  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  43.22 
 
 
249 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  48.03 
 
 
244 aa  205  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  42.23 
 
 
287 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  42.44 
 
 
220 aa  179  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  39.61 
 
 
308 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  38.43 
 
 
320 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  38.78 
 
 
306 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  37.1 
 
 
303 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  39.84 
 
 
310 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  33.19 
 
 
275 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  33.04 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  33.33 
 
 
261 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  34.3 
 
 
270 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  35.63 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  31.91 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  32.45 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  35.54 
 
 
259 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  32.79 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  31.3 
 
 
237 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  36.29 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  35.68 
 
 
258 aa  128  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  35.66 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  36.52 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  33.61 
 
 
257 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  34.36 
 
 
272 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  34.36 
 
 
272 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  30.89 
 
 
259 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  37.23 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  29.87 
 
 
319 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  33.04 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  27.43 
 
 
284 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  31.18 
 
 
263 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  30.9 
 
 
268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  36.9 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  33.04 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  36.36 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  34.76 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  30.89 
 
 
280 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  32.26 
 
 
257 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  29.27 
 
 
268 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  28.71 
 
 
231 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  30.64 
 
 
264 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  30.85 
 
 
262 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  30 
 
 
278 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  31.25 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  27.6 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  29.11 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  25.29 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  28.27 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  22.82 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.99 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  32.42 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  27.84 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.71 
 
 
216 aa  62.4  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  25.5 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  25.64 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  27.45 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  26.09 
 
 
255 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  24.7 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  25.85 
 
 
207 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  25.35 
 
 
258 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  25.1 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  25.95 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  25.78 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  25.22 
 
 
212 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  26.52 
 
 
211 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  24.14 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  27.69 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  24.46 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  27.54 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  22.67 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  24.69 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  25.66 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  24.69 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  27.69 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  24.43 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  26.38 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.27 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.27 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.27 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.27 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  23.36 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.68 
 
 
219 aa  42  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.27 
 
 
210 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>