More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0114 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  100 
 
 
104 aa  216  6e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  61.54 
 
 
104 aa  148  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  57.28 
 
 
103 aa  133  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  52.88 
 
 
104 aa  130  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  48.04 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  46.88 
 
 
104 aa  105  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  42.72 
 
 
104 aa  104  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  43.27 
 
 
105 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  44.23 
 
 
104 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  44.23 
 
 
104 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  43.27 
 
 
104 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  44.23 
 
 
104 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  45.19 
 
 
104 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  48.91 
 
 
104 aa  100  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  38.46 
 
 
108 aa  100  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  36.63 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  46.91 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  52.63 
 
 
108 aa  90.1  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  42.05 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  41.51 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  41.18 
 
 
124 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  42.27 
 
 
106 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  44.83 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  40.2 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  42 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  40.59 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  40.59 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  39.58 
 
 
106 aa  87.4  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  46.08 
 
 
108 aa  87  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  87  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  40.2 
 
 
108 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  36.67 
 
 
106 aa  87  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  39.58 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  37.76 
 
 
110 aa  85.9  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  38.1 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  47.5 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  38.38 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  39.05 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  35.35 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  45.24 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  42.53 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  40.59 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  37.62 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  40.82 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  40.62 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  37.25 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  45.12 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  33.67 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  38.14 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  39.81 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  38.61 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  36.54 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  36.54 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  35.58 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  35.58 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  35.58 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  35.58 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  35.58 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  36.54 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  35.58 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  36.54 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  35.58 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  40.82 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  36.54 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  36.54 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  36.54 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  47.56 
 
 
88 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  35.58 
 
 
146 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  36.96 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  37.37 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  40.82 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  39.78 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  39 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  40.2 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  40.59 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  40.82 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  40.78 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  37.37 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  40.82 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  38.38 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3221  thioredoxin  37.86 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  42.57 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  36.36 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  48.68 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  42.86 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  40.57 
 
 
109 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  37.25 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  38.24 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  43.75 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  36.27 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  41.67 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  38.61 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  40 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  35.64 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  35.58 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  37.89 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  39.39 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  35.58 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>