39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0094 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0094  signal transduction protein  100 
 
 
436 aa  873    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.41097  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1650  signal transduction protein  35.42 
 
 
446 aa  150  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3042  histidine kinase domain protein  28.83 
 
 
406 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00679309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2744  histidine kinase  29.28 
 
 
438 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00108764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2724  sensor histidine kinase  29.28 
 
 
438 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3005  histidine kinase domain protein  29.28 
 
 
406 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3043  histidine kinase domain-containing protein  28.83 
 
 
438 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.795869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3007  histidine kinase domain-containing protein  28.83 
 
 
438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2795  histidine kinase domain-containing protein  28.83 
 
 
438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.921315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1492  accessory gene regulator protein C  28.73 
 
 
429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108947  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0009  signal transduction protein  26.67 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1311  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.4 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.766434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.8 
 
 
342 aa  63.5  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.6 
 
 
479 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.37 
 
 
275 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.69 
 
 
445 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000227922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.51 
 
 
456 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728956 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  27.36 
 
 
529 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  25.37 
 
 
529 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  26.13 
 
 
529 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  26.13 
 
 
529 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  24.75 
 
 
529 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  25.37 
 
 
529 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.38 
 
 
529 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0385  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.26 
 
 
280 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.87 
 
 
534 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2862  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25 
 
 
434 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000109572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  22.61 
 
 
529 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  24.62 
 
 
529 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.75 
 
 
545 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25 
 
 
540 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.71 
 
 
531 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.51 
 
 
521 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  31.45 
 
 
533 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1570  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.72 
 
 
278 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000677983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.11 
 
 
460 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.95 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  23.47 
 
 
516 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.93 
 
 
553 aa  44.3  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>