145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0079 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  100 
 
 
334 aa  668  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  65.09 
 
 
359 aa  433  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  44.44 
 
 
347 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  45.51 
 
 
331 aa  292  6e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  46.05 
 
 
328 aa  264  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  41.72 
 
 
333 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  39.88 
 
 
334 aa  238  8e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  38.94 
 
 
337 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.43 
 
 
584 aa  205  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  35.62 
 
 
341 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  36.7 
 
 
329 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  36.73 
 
 
321 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  34.26 
 
 
329 aa  196  4e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  36.73 
 
 
322 aa  196  5e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.37 
 
 
320 aa  194  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  40.42 
 
 
319 aa  192  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  35.31 
 
 
322 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  36.08 
 
 
321 aa  189  6e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.14 
 
 
323 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  36.08 
 
 
321 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  36.08 
 
 
321 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.14 
 
 
323 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.14 
 
 
323 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  35.14 
 
 
323 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.14 
 
 
323 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.14 
 
 
323 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  36.08 
 
 
321 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.44 
 
 
325 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.8 
 
 
323 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  35.15 
 
 
321 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  34.8 
 
 
323 aa  185  1e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  35.35 
 
 
322 aa  184  2e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  34.35 
 
 
324 aa  183  4e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  34.71 
 
 
321 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  35.16 
 
 
270 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  32.65 
 
 
324 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  34.25 
 
 
323 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  35.12 
 
 
320 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  33.64 
 
 
329 aa  176  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  31.51 
 
 
316 aa  174  2e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  31.48 
 
 
343 aa  173  4e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  31.83 
 
 
323 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  34.02 
 
 
329 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  30.61 
 
 
338 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  32.31 
 
 
317 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  33.89 
 
 
326 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  33.45 
 
 
323 aa  167  3e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  30.95 
 
 
317 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  30.61 
 
 
317 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  33.22 
 
 
326 aa  165  1e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  32.76 
 
 
322 aa  165  1e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.03 
 
 
321 aa  164  2e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  30.65 
 
 
329 aa  164  2e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  30.03 
 
 
324 aa  163  4e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  32.76 
 
 
322 aa  163  4e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  30.64 
 
 
317 aa  163  5e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.35 
 
 
336 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.69 
 
 
321 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  31.97 
 
 
332 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  32.41 
 
 
344 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  33.22 
 
 
335 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  32.65 
 
 
332 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  31.09 
 
 
325 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  29.9 
 
 
341 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  32.05 
 
 
331 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  32.13 
 
 
337 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  29.05 
 
 
341 aa  156  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  30.63 
 
 
325 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  31.27 
 
 
370 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  33.56 
 
 
320 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  30.51 
 
 
319 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  29.15 
 
 
349 aa  150  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  29.15 
 
 
349 aa  149  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  32.32 
 
 
330 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  31.72 
 
 
323 aa  148  2e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  30.36 
 
 
328 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  30.98 
 
 
313 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.77 
 
 
327 aa  140  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  29.45 
 
 
327 aa  140  4e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  28.3 
 
 
340 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  28.21 
 
 
298 aa  125  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  25.08 
 
 
331 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  27.11 
 
 
320 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  29.13 
 
 
322 aa  121  2e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  29.51 
 
 
640 aa  115  1e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  25.17 
 
 
322 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.8 
 
 
352 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  21.77 
 
 
324 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  22.03 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  23.81 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.79 
 
 
344 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  24.64 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  24.14 
 
 
344 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  22.78 
 
 
328 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  22.71 
 
 
309 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  23.3 
 
 
354 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  25.77 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  25.64 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  26.58 
 
 
315 aa  84.7  2e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2999  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.08 
 
 
350 aa  84.3  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000215349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>