More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0075 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  100 
 
 		 318 aa  618  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  69.4 
 
 		 318 aa  465  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  66.77 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  64.67 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  63.72 
 
 		 317 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  57.59 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  57.28 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  54.11 
 
 		 319 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  54.11 
 
 		 319 aa  340  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  53.8 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  53.8 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  53.8 
 
 		 319 aa  338  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  53.8 
 
 		 319 aa  338  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  53.8 
 
 		 319 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  53.48 
 
 		 319 aa  338  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  53.48 
 
 		 319 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  51.75 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  45.57 
 
 		 317 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  44.92 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  45.07 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  42.94 
 
 		 307 aa  241  9e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  42.73 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  44.15 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 286 aa  222  7e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  43.67 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  40.81 
 
 		 321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  39.94 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  41.23 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  41.91 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  41.86 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  40.57 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  44.21 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  38.2 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 321 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  38.53 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  38.53 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  39.42 
 
 		 284 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  39.42 
 
 		 284 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  38.02 
 
 		 435 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 447 aa  175  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 288 aa  175  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.84 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 445 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 440 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  36.34 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  39.49 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 428 aa  155  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1414  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.381128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  32.17 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  33.68 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.79 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>