More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_D39 on replicon NC_008506
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  80.43 
 
 
470 aa  800    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  81.49 
 
 
470 aa  810    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  100 
 
 
468 aa  966    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  81.49 
 
 
470 aa  810    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  55.36 
 
 
468 aa  545  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  54.82 
 
 
475 aa  520  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  51.18 
 
 
484 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  38.89 
 
 
469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  38.35 
 
 
446 aa  306  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  37.66 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  38 
 
 
469 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  38.27 
 
 
467 aa  292  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  36.34 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  35.41 
 
 
453 aa  286  7e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  34.27 
 
 
474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  35.92 
 
 
451 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  36.97 
 
 
478 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  37.05 
 
 
448 aa  282  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  38.1 
 
 
464 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  37.26 
 
 
446 aa  280  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  35.82 
 
 
439 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  35.04 
 
 
452 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  36.79 
 
 
478 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  35.73 
 
 
444 aa  269  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  36.67 
 
 
461 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  34.55 
 
 
458 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  37.34 
 
 
478 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  35.82 
 
 
438 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  35.5 
 
 
443 aa  264  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  35.61 
 
 
470 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  34.99 
 
 
447 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  35.28 
 
 
470 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  33.76 
 
 
453 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  35.7 
 
 
459 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  34.75 
 
 
463 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  34.31 
 
 
446 aa  257  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  35.08 
 
 
448 aa  257  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  34.1 
 
 
478 aa  256  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  33.97 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  34.31 
 
 
446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  34.51 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  34.47 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  33.05 
 
 
452 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  36.79 
 
 
482 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  34.04 
 
 
484 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  35.42 
 
 
440 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  34.97 
 
 
461 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  34.1 
 
 
467 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  33.91 
 
 
439 aa  250  4e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  32.91 
 
 
462 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  33.48 
 
 
462 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  33.2 
 
 
467 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  33.4 
 
 
470 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  31.76 
 
 
500 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  35.24 
 
 
470 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  33.74 
 
 
465 aa  247  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  33.76 
 
 
465 aa  247  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  35.41 
 
 
450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  34.33 
 
 
476 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  35.19 
 
 
457 aa  246  9e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  33.4 
 
 
465 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  35.82 
 
 
474 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  34.76 
 
 
463 aa  243  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  33.61 
 
 
470 aa  243  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  32.77 
 
 
494 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  35.36 
 
 
436 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  33.9 
 
 
458 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  34.4 
 
 
472 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  33.76 
 
 
488 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  32.77 
 
 
459 aa  240  4e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  33.96 
 
 
461 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  34.24 
 
 
455 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  32.78 
 
 
479 aa  239  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  30.72 
 
 
499 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  33.99 
 
 
463 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  34.55 
 
 
470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  33.55 
 
 
458 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  32.58 
 
 
466 aa  236  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  33.76 
 
 
453 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  33.19 
 
 
460 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  31.58 
 
 
488 aa  236  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  32.44 
 
 
491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  33.05 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  31.43 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  32 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  32.98 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  33.41 
 
 
456 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  32.37 
 
 
460 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  32.78 
 
 
460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  32.42 
 
 
449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  32.57 
 
 
460 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0765  6-phospho-beta-glucosidase  34.77 
 
 
465 aa  233  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10124  beta-glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14710)  33.2 
 
 
483 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0847902  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  31.89 
 
 
458 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  32.63 
 
 
468 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  32.54 
 
 
467 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.37 
 
 
474 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  31.47 
 
 
462 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2840  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.23 
 
 
474 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.106134 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0996  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.16 
 
 
474 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0301517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>