246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C44 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008505  LACR_C44  transposase  100 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  99.12 
 
 
226 aa  461  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  98.67 
 
 
226 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  98.23 
 
 
226 aa  457  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  96.02 
 
 
226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  96.02 
 
 
226 aa  443  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  95.58 
 
 
226 aa  441  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  95.58 
 
 
226 aa  441  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  95.58 
 
 
226 aa  442  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  92.48 
 
 
226 aa  433  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  90.71 
 
 
236 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  81.86 
 
 
226 aa  391  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  81.86 
 
 
226 aa  391  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  81.86 
 
 
226 aa  391  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  81.42 
 
 
226 aa  388  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  57.85 
 
 
224 aa  266  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  58.74 
 
 
224 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  58.74 
 
 
224 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  57.85 
 
 
224 aa  265  5e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  57.85 
 
 
224 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  57.85 
 
 
224 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  57.85 
 
 
224 aa  264  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  57.85 
 
 
224 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  57.85 
 
 
224 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  57.85 
 
 
224 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  57.85 
 
 
224 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  57.85 
 
 
224 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  56.05 
 
 
224 aa  259  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  77.56 
 
 
164 aa  259  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  59.72 
 
 
214 aa  252  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  62.87 
 
 
221 aa  251  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  62.87 
 
 
221 aa  251  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  56.16 
 
 
208 aa  235  4e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  45.71 
 
 
240 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  45.71 
 
 
234 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  45.71 
 
 
240 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  45.85 
 
 
302 aa  180  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  45.85 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  44.7 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  44.4 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  44.7 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  44.7 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  43.56 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  45.28 
 
 
238 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  42.92 
 
 
235 aa  169  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  42.24 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  42.38 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  55.97 
 
 
134 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  41.44 
 
 
228 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  41.44 
 
 
228 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  40.79 
 
 
255 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  40.29 
 
 
235 aa  158  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  39.9 
 
 
235 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  40.1 
 
 
235 aa  158  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  39.61 
 
 
235 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  40.99 
 
 
228 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  40.51 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  40.09 
 
 
227 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  39.9 
 
 
222 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  42.46 
 
 
185 aa  148  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  42.46 
 
 
185 aa  148  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  42.18 
 
 
246 aa  148  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  37.75 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  37.38 
 
 
230 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.38 
 
 
230 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  37.38 
 
 
230 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.38 
 
 
230 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  41.34 
 
 
206 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  42.94 
 
 
181 aa  141  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  36.19 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  36.19 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1583  IS431mec-like transposase  66.34 
 
 
107 aa  136  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  34.93 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  34.93 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  36.57 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1588  IS431mec-like transposase  52 
 
 
140 aa  134  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.363136  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  37.06 
 
 
238 aa  134  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  39.06 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>