More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C37 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  32.52 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.19 
 
 		 198 aa  72  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  26.16 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
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NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  29.46 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
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NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  29.77 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0469  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  21.32 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  25.81 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
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