257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C12 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008505  LACR_C12  transposase  100 
 
 		 226 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  96.9 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  96.46 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  96.02 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  96.02 
 
 		 226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  95.58 
 
 		 226 aa  443  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  94.69 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  94.69 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  94.69 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  93.36 
 
 		 226 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  91.59 
 
 		 236 aa  428  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  82.3 
 
 		 226 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  82.3 
 
 		 226 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  82.3 
 
 		 226 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  81.86 
 
 		 226 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  58.74 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  58.74 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  57.85 
 
 		 224 aa  261  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  57.85 
 
 		 224 aa  261  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  57.85 
 
 		 224 aa  261  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  57.85 
 
 		 224 aa  261  8e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  57.85 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  57.85 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  57.85 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  57.85 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  57.85 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  57.85 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  79.08 
 
 		 164 aa  257  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  56.05 
 
 		 224 aa  256  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  59.72 
 
 		 214 aa  249  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  62.56 
 
 		 221 aa  248  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  62.56 
 
 		 221 aa  248  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  56.16 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  44.76 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  44.76 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  44.1 
 
 		 302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  45.16 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  45.16 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  45.16 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  44.1 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  43.36 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  45.28 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  42.24 
 
 		 235 aa  165  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  41.63 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  56.72 
 
 		 134 aa  160  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  40.95 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  41.9 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  40.36 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  40.36 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  40.79 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  41.03 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  39.91 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  40.29 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  39.9 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  40.1 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  39.9 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  40.09 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  38.83 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  40.68 
 
 		 185 aa  142  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.8 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.8 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  37.8 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  37.8 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  40.68 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  40.09 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  37.32 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  37.23 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1588  IS431mec-like transposase  53.6 
 
 		 140 aa  138  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.363136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  39.55 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  40.46 
 
 		 181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  37.44 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  36.19 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  36.6 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  36.99 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  37.69 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  36.07 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>