259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_A03 on replicon NC_008503
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008503  LACR_A03  transposase  100 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  100 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  100 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  99.56 
 
 
226 aa  461  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  84.51 
 
 
226 aa  404  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  83.19 
 
 
226 aa  402  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  82.74 
 
 
226 aa  397  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  82.74 
 
 
236 aa  397  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  82.74 
 
 
226 aa  395  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  83.19 
 
 
226 aa  397  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  82.3 
 
 
226 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  81.86 
 
 
226 aa  391  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  81.86 
 
 
226 aa  391  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  82.59 
 
 
226 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  82.59 
 
 
226 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  94.7 
 
 
164 aa  296  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  60.99 
 
 
224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  60.99 
 
 
224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  60.99 
 
 
224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  60.99 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  60.99 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  60.99 
 
 
224 aa  272  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  60.99 
 
 
224 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  60.99 
 
 
224 aa  271  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  60.99 
 
 
224 aa  271  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  60.99 
 
 
224 aa  271  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  60.99 
 
 
224 aa  271  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  60.99 
 
 
224 aa  271  7e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  59.19 
 
 
224 aa  268  4e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  64.04 
 
 
221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  64.04 
 
 
221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  62.09 
 
 
214 aa  256  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  60.1 
 
 
208 aa  244  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  46.19 
 
 
234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  46.19 
 
 
240 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  45.75 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  45.75 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  45.75 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  42.03 
 
 
235 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  42.36 
 
 
235 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  43.23 
 
 
235 aa  169  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  42.44 
 
 
235 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  43.23 
 
 
302 aa  170  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  42.03 
 
 
235 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  42.03 
 
 
235 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  44.34 
 
 
238 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  41.98 
 
 
218 aa  168  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  43.04 
 
 
235 aa  167  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  55.22 
 
 
134 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  42.72 
 
 
222 aa  165  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  39.19 
 
 
228 aa  164  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  40.51 
 
 
236 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  41.98 
 
 
255 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  41.3 
 
 
235 aa  157  9e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  38.76 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  37.84 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  37.84 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  37.84 
 
 
230 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.84 
 
 
230 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  37.84 
 
 
230 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.84 
 
 
230 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  42.37 
 
 
185 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  42.37 
 
 
185 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  40.58 
 
 
246 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  36.96 
 
 
228 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  41.24 
 
 
206 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  41.62 
 
 
181 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1583  IS431mec-like transposase  72.28 
 
 
107 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  35.12 
 
 
243 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  36.55 
 
 
238 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  42.05 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  37.17 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  37.79 
 
 
250 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  38.25 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.25 
 
 
346 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  36.27 
 
 
263 aa  138  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>