More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2583 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
130 aa  263  8e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  86.92 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  84.62 
 
 
130 aa  230  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  77.34 
 
 
131 aa  211  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  77.95 
 
 
131 aa  203  8e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  72.31 
 
 
130 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 
130 aa  192  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  71.54 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  71.54 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  71.54 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  71.54 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  71.54 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  71.54 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  71.54 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 
130 aa  191  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  70 
 
 
130 aa  190  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  70 
 
 
130 aa  190  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 
130 aa  189  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 
130 aa  189  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  71.09 
 
 
131 aa  186  9e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 
130 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0629  SSU ribosomal protein S9P  76.15 
 
 
130 aa  184  5e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391075  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  66.15 
 
 
130 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  66.15 
 
 
130 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  66.15 
 
 
130 aa  173  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  168  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  65.12 
 
 
131 aa  167  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  65.12 
 
 
131 aa  167  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  168  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  166  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  61.54 
 
 
130 aa  166  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  70 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  59.23 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  158  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  64.23 
 
 
166 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 
158 aa  156  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  61.72 
 
 
130 aa  155  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  64 
 
 
130 aa  155  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  59.23 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 
180 aa  154  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  62.1 
 
 
173 aa  153  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
160 aa  153  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 
169 aa  153  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  59.02 
 
 
129 aa  152  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 
188 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  60.8 
 
 
169 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  63.11 
 
 
165 aa  152  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  57.36 
 
 
132 aa  151  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  150  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  59.23 
 
 
130 aa  150  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  61.29 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  63.57 
 
 
131 aa  149  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 
160 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 
130 aa  149  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  148  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  147  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  59.68 
 
 
170 aa  147  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  60.63 
 
 
133 aa  147  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 
168 aa  147  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 
130 aa  146  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  58.54 
 
 
130 aa  146  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  56.92 
 
 
130 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 
130 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  59.52 
 
 
132 aa  146  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 
130 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
162 aa  145  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  58.73 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  144  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  144  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  144  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  144  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  144  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  144  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 
158 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  144  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 
130 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  57.78 
 
 
135 aa  144  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  54.62 
 
 
130 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  60 
 
 
131 aa  144  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  56.15 
 
 
130 aa  144  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  51.54 
 
 
130 aa  143  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>