More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2541 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  49.66 
 
 		 145 aa  149  8.999999999999999e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  48.61 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  45.83 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  44.83 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  43.75 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 		 152 aa  123  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  40.28 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  40.28 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  40.28 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  40.28 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  40.28 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  40.28 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  40.28 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  40.28 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  39.58 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  39.58 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  40.71 
 
 		 166 aa  116  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.55 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  41.78 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.99 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  39.33 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.24 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.69 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.3 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  31.94 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32.65 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.06 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.99 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  29.19 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  29.19 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.94 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  38.3 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  34.69 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  38.3 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  38.3 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.79 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32.64 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  23.97 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  31.71 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  31.72 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.17 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  30.82 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  30.82 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.9 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.69 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  31.71 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.56 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  32.19 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 278 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  31.03 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  28.22 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0340  UspA family nucleotide-binding protein  32.41 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000238748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.22 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.87 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  30.34 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.57 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  26.81 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  30.34 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  29.3 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.66 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  31.03 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  32.88 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.13 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  31.72 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  28.77 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1794  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.89 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>