135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2539 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2539  cAMP-binding protein - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinase  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000419866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1735  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
219 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00117322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.84 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.3 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.37 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 
230 aa  89  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  25.81 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  25.23 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  24.77 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0411  transcriptional regulator, Crp family  27.45 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000553573 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0345  Crp family transcriptional regulator  27.45 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.254354  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.56 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  24.04 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.54 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0477  Crp family transcriptional regulator  26.5 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0933534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4894  transcriptional regulator, Crp family  26.5 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0770605  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
227 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.74 
 
 
238 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 
238 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.89 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0424  transcriptional regulator, Crp family  26 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.28 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.87 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0352  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.52 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.91 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  23.2 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.51 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.74 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.87 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.27 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  24.43 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0394  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.89 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  24.63 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.77 
 
 
226 aa  51.6  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.58 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  21.83 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.4 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
310 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
253 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.53 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.07 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.86 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.4 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.34 
 
 
219 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 
225 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  26.9 
 
 
214 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.62 
 
 
239 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.3 
 
 
250 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.61 
 
 
230 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.48 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.16 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.79 
 
 
234 aa  45.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.86 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.52 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  24 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.5 
 
 
228 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  18.52 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1291  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
305 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.06322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
236 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.98 
 
 
220 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.18 
 
 
231 aa  45.1  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.93 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.42 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.82 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  23.81 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  23.81 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  23.81 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  23.81 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  23.81 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>