221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2536 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  37.54 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  36.46 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  36.79 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  33.47 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  32.63 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  31.45 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  32.06 
 
 		 283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  31.93 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  32.53 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  31.83 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  33.92 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  33.92 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  31.23 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  31.01 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  30.66 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.33 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 275 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.06 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  26.86 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  23.76 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  26.06 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  23.81 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  29.2 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  28.94 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  27.48 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  26.25 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  20.96 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  27.4 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.61 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.61 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.7 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  25.83 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  35.2 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  23.65 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.36 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  24.91 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  24.65 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  29.86 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  25.52 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0106  Rod shape-determining protein MreC  27.56 
 
 		 261 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  26.29 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  24.39 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  25.59 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  24.7 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  24.29 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  24.39 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  26.59 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  24.72 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  25.62 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  23.08 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  25.6 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  23.08 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  34.4 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  21.35 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  23.58 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  22.27 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  23.58 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  33.61 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>