More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2404 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  837    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  43.29 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  45.48 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 458 aa  156  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 464 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 475 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  24.47 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 450 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 468 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 461 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  27.02 
 
 		 484 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.79 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 483 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.16 
 
 		 546 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 495 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.79 
 
 		 546 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  26.79 
 
 		 547 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  26.79 
 
 		 495 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  26.79 
 
 		 547 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  26.91 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  26.91 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 464 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.45 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  24.76 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  26.19 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  25.87 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  25.7 
 
 		 474 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  25.7 
 
 		 474 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  25.59 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  26.57 
 
 		 502 aa  106  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  26.69 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.62 
 
 		 464 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 445 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  24.65 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 486 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  25.06 
 
 		 476 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  26.15 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 475 aa  99.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 458 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.01 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  25.81 
 
 		 480 aa  97.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 450 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 458 aa  96.7  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 467 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 447 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.78 
 
 		 462 aa  94  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 447 aa  94  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  22.25 
 
 		 446 aa  93.6  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  21.09 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0850  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.313022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 458 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.08 
 
 		 469 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 462 aa  90.1  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 461 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.81 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  23.12 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  21.41 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  21.41 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  25 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>