More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2381 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
439 aa  875    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  67.67 
 
 
434 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  66.28 
 
 
431 aa  592  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  56.58 
 
 
438 aa  510  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  52.66 
 
 
431 aa  457  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.84 
 
 
444 aa  435  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  48.97 
 
 
430 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  49.43 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  50 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  47.14 
 
 
433 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  47.14 
 
 
433 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  47.14 
 
 
433 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  47.14 
 
 
433 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  47.14 
 
 
433 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  47.37 
 
 
433 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  47.14 
 
 
433 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  47.37 
 
 
433 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  47.37 
 
 
433 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  45.79 
 
 
434 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  46.91 
 
 
433 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  45.21 
 
 
434 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  45.33 
 
 
434 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  45.43 
 
 
434 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  45.43 
 
 
434 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  45.33 
 
 
434 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  45.77 
 
 
434 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
434 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  45.33 
 
 
434 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  44.72 
 
 
434 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  44.39 
 
 
434 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  45.08 
 
 
430 aa  361  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  45.08 
 
 
430 aa  361  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  43.65 
 
 
430 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  42.56 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  38.37 
 
 
435 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.38 
 
 
419 aa  310  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  40.77 
 
 
445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0142  preprotein translocase, SecY subunit  46.42 
 
 
355 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.58947e-61 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  40.37 
 
 
421 aa  309  8e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  39.37 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  40.67 
 
 
421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  39.55 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  39.28 
 
 
435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  38.13 
 
 
424 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  40.31 
 
 
430 aa  300  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  37.19 
 
 
435 aa  299  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  37.87 
 
 
437 aa  299  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  37.47 
 
 
435 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  39.22 
 
 
420 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  38.7 
 
 
437 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  39.27 
 
 
418 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  39.13 
 
 
447 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  36.88 
 
 
435 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  38.25 
 
 
447 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  38.68 
 
 
434 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  38.68 
 
 
439 aa  293  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  39.91 
 
 
449 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  38.28 
 
 
437 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  39.38 
 
 
446 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  38.25 
 
 
447 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  36.73 
 
 
435 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  39.64 
 
 
428 aa  290  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  38.07 
 
 
448 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  36.1 
 
 
429 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  37.15 
 
 
440 aa  289  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.04 
 
 
463 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  38.85 
 
 
419 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  37.91 
 
 
441 aa  288  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  39.22 
 
 
422 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0677  preprotein translocase subunit SecY  39.4 
 
 
482 aa  287  2e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  35.17 
 
 
435 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  37.39 
 
 
442 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  37.91 
 
 
446 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  38.35 
 
 
443 aa  286  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  38.11 
 
 
426 aa  286  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.3 
 
 
442 aa  285  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  37.67 
 
 
441 aa  285  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  38.75 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  38.6 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  38.46 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  38.59 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  38.6 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000838517  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  39.02 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  37.41 
 
 
435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  37.92 
 
 
436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  36.49 
 
 
444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  36.49 
 
 
444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  38.62 
 
 
439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  37.44 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  37.33 
 
 
423 aa  283  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  37.73 
 
 
448 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  36.95 
 
 
442 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  36.95 
 
 
442 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  37.39 
 
 
443 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  37.39 
 
 
443 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  37.96 
 
 
446 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  36.19 
 
 
446 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  36.98 
 
 
446 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  37.35 
 
 
446 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  36.99 
 
 
446 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>